https://github.com/jferna10/EnvPaper
Tip revision: 033e4b3f79057958cd18c17a5701f8fd4f766ec7 authored by jferna10 on 15 July 2021, 06:14:41 UTC
formatting
formatting
Tip revision: 033e4b3
FastqSummaryF1L1.txt
SampleNumber Tile NumberOfReadsRaw NumberOfReadsPF
0 1101 101716 84456
1 1101 2146 2060
2 1101 899 853
3 1101 1507 1430
4 1101 1831 1762
5 1101 3389 3248
6 1101 4972 4732
7 1101 1637 1549
8 1101 733 696
9 1101 1489 1431
10 1101 3528 3375
11 1101 9274 8840
12 1101 268 254
13 1101 32588 30974
14 1101 15052 14490
15 1101 1699 1640
16 1101 1816 1730
17 1101 1879 1791
18 1101 1963 1871
19 1101 949 902
20 1101 2039 1951
21 1101 2131 2017
22 1101 599 577
23 1101 722 687
24 1101 1844 1757
25 1101 20240 19183
26 1101 7770 7391
27 1101 2696 2556
28 1101 1891 1787
29 1101 1971 1877
30 1101 2306 2194
31 1101 341 322
32 1101 1950 1867
33 1101 947 903
34 1101 7 7
35 1101 14 14
36 1101 1 1
37 1101 9743 9301
38 1101 9456 8929
39 1101 2107 2029
40 1101 3436 3298
41 1101 6280 6015
42 1101 3026 2873
43 1101 1515 1427
44 1101 1235 1175
45 1101 1852 1772
46 1101 7034 6699
47 1101 3479 3304
48 1101 808 768
49 1101 16745 15846
50 1101 10703 10167
51 1101 11650 11125
52 1101 7441 7089
53 1101 3086 2907
54 1101 913 852
55 1101 945 896
56 1101 3357 3209
57 1101 2983 2813
58 1101 389 365
59 1101 1575 1502
60 1101 2190 2084
61 1101 35354 33687
62 1101 15807 14981
63 1101 7406 7042
64 1101 2886 2732
65 1101 3218 3047
66 1101 2853 2710
67 1101 2178 2065
68 1101 2602 2475
69 1101 3247 3109
70 1101 70 63
71 1101 40 38
72 1101 15 14
0 1102 102701 85746
1 1102 2219 2128
2 1102 923 877
3 1102 1555 1473
4 1102 1876 1778
5 1102 3312 3171
6 1102 5055 4842
7 1102 1632 1553
8 1102 718 674
9 1102 1507 1437
10 1102 3506 3357
11 1102 9508 9008
12 1102 276 264
13 1102 33254 31528
14 1102 15037 14470
15 1102 1711 1636
16 1102 1744 1656
17 1102 1983 1886
18 1102 1930 1835
19 1102 932 887
20 1102 1940 1844
21 1102 2123 2019
22 1102 593 557
23 1102 756 714
24 1102 1906 1811
25 1102 20344 19210
26 1102 7914 7505
27 1102 2669 2523
28 1102 1942 1843
29 1102 2030 1937
30 1102 2329 2219
31 1102 378 362
32 1102 2030 1923
33 1102 958 909
34 1102 10 10
35 1102 8 7
36 1102 1 1
37 1102 9990 9523
38 1102 9507 9016
39 1102 2184 2079
40 1102 3604 3439
41 1102 6257 5982
42 1102 3004 2854
43 1102 1538 1459
44 1102 1272 1209
45 1102 1857 1787
46 1102 7196 6835
47 1102 3543 3350
48 1102 905 861
49 1102 16854 15902
50 1102 10886 10355
51 1102 11536 11022
52 1102 7703 7332
53 1102 3089 2943
54 1102 953 888
55 1102 975 919
56 1102 3310 3165
57 1102 3076 2917
58 1102 361 348
59 1102 1572 1502
60 1102 2252 2138
61 1102 35643 33900
62 1102 16077 15224
63 1102 7255 6880
64 1102 3108 2950
65 1102 3271 3084
66 1102 2965 2834
67 1102 2217 2121
68 1102 2661 2518
69 1102 3437 3269
70 1102 61 57
71 1102 49 45
72 1102 13 12
0 1103 102222 86087
1 1103 2144 2062
2 1103 871 835
3 1103 1537 1441
4 1103 1863 1783
5 1103 3317 3170
6 1103 5140 4907
7 1103 1617 1547
8 1103 709 675
9 1103 1517 1443
10 1103 3594 3429
11 1103 9620 9165
12 1103 267 255
13 1103 33023 31366
14 1103 15066 14513
15 1103 1755 1653
16 1103 1760 1690
17 1103 1899 1804
18 1103 1903 1822
19 1103 954 909
20 1103 2035 1959
21 1103 2098 2005
22 1103 615 593
23 1103 740 703
24 1103 1901 1800
25 1103 20657 19636
26 1103 7900 7514
27 1103 2648 2534
28 1103 1994 1890
29 1103 2054 1939
30 1103 2340 2217
31 1103 365 347
32 1103 2009 1907
33 1103 948 906
34 1103 4 4
35 1103 14 14
36 1103 0 0
37 1103 10047 9632
38 1103 9426 8955
39 1103 2146 2055
40 1103 3431 3298
41 1103 6366 6106
42 1103 2952 2822
43 1103 1541 1462
44 1103 1182 1120
45 1103 1811 1729
46 1103 7072 6740
47 1103 3493 3306
48 1103 899 864
49 1103 16736 15849
50 1103 11198 10663
51 1103 11908 11387
52 1103 7557 7206
53 1103 3025 2881
54 1103 919 867
55 1103 1025 969
56 1103 3295 3138
57 1103 3038 2911
58 1103 443 424
59 1103 1545 1495
60 1103 2341 2241
61 1103 35715 34137
62 1103 15994 15166
63 1103 7309 6950
64 1103 3004 2822
65 1103 3384 3202
66 1103 2981 2873
67 1103 2105 2005
68 1103 2626 2489
69 1103 3385 3235
70 1103 62 60
71 1103 50 45
72 1103 15 13
0 1104 102735 87469
1 1104 2223 2139
2 1104 835 792
3 1104 1489 1421
4 1104 1931 1845
5 1104 3307 3144
6 1104 5005 4795
7 1104 1609 1542
8 1104 776 743
9 1104 1582 1514
10 1104 3502 3362
11 1104 9585 9174
12 1104 249 240
13 1104 33525 31997
14 1104 15232 14671
15 1104 1715 1638
16 1104 1740 1666
17 1104 1897 1822
18 1104 1977 1906
19 1104 960 909
20 1104 2024 1934
21 1104 2166 2064
22 1104 572 547
23 1104 798 756
24 1104 1967 1887
25 1104 20722 19698
26 1104 7780 7440
27 1104 2778 2673
28 1104 2007 1919
29 1104 2101 2024
30 1104 2380 2244
31 1104 378 366
32 1104 2065 1973
33 1104 971 923
34 1104 8 8
35 1104 11 11
36 1104 0 0
37 1104 10031 9600
38 1104 9403 8932
39 1104 2206 2124
40 1104 3556 3409
41 1104 6321 6046
42 1104 3074 2936
43 1104 1523 1451
44 1104 1262 1196
45 1104 1942 1848
46 1104 7148 6810
47 1104 3619 3419
48 1104 950 912
49 1104 17123 16312
50 1104 11072 10592
51 1104 11916 11425
52 1104 7689 7370
53 1104 3098 2946
54 1104 940 890
55 1104 935 900
56 1104 3427 3265
57 1104 3074 2969
58 1104 379 364
59 1104 1556 1493
60 1104 2278 2162
61 1104 35951 34412
62 1104 16158 15370
63 1104 7546 7197
64 1104 3072 2936
65 1104 3301 3132
66 1104 3028 2903
67 1104 2126 2020
68 1104 2677 2531
69 1104 3508 3367
70 1104 68 63
71 1104 53 48
72 1104 16 14
0 2101 98479 84726
1 2101 2135 2061
2 2101 833 808
3 2101 1495 1441
4 2101 1880 1803
5 2101 3147 3022
6 2101 4911 4727
7 2101 1556 1484
8 2101 742 715
9 2101 1481 1433
10 2101 3449 3330
11 2101 9226 8834
12 2101 245 232
13 2101 32084 30855
14 2101 14921 14443
15 2101 1722 1650
16 2101 1829 1754
17 2101 1946 1872
18 2101 1896 1804
19 2101 937 898
20 2101 2018 1945
21 2101 2005 1925
22 2101 596 575
23 2101 737 706
24 2101 1826 1736
25 2101 20159 19357
26 2101 7702 7342
27 2101 2634 2536
28 2101 1994 1920
29 2101 2078 2000
30 2101 2238 2142
31 2101 370 352
32 2101 1989 1903
33 2101 964 911
34 2101 4 4
35 2101 11 11
36 2101 2 2
37 2101 9794 9437
38 2101 9295 8840
39 2101 2206 2132
40 2101 3484 3358
41 2101 6148 5918
42 2101 2861 2756
43 2101 1463 1408
44 2101 1225 1182
45 2101 1845 1793
46 2101 7127 6811
47 2101 3355 3235
48 2101 844 811
49 2101 16554 15877
50 2101 10726 10283
51 2101 11414 11011
52 2101 7326 6978
53 2101 2967 2860
54 2101 900 865
55 2101 959 915
56 2101 3258 3131
57 2101 2998 2881
58 2101 393 375
59 2101 1535 1490
60 2101 2163 2084
61 2101 35048 33717
62 2101 15920 15286
63 2101 7076 6776
64 2101 3000 2872
65 2101 3113 2967
66 2101 2975 2867
67 2101 2109 2025
68 2101 2557 2448
69 2101 3311 3175
70 2101 43 41
71 2101 55 52
72 2101 7 7
0 2102 100416 84608
1 2102 2178 2078
2 2102 885 835
3 2102 1513 1432
4 2102 1853 1764
5 2102 3186 3031
6 2102 4975 4777
7 2102 1588 1504
8 2102 743 704
9 2102 1544 1457
10 2102 3375 3227
11 2102 9522 9053
12 2102 257 245
13 2102 32263 30592
14 2102 14937 14348
15 2102 1747 1668
16 2102 1748 1670
17 2102 1864 1764
18 2102 1872 1784
19 2102 914 878
20 2102 1965 1883
21 2102 2046 1956
22 2102 587 561
23 2102 824 780
24 2102 1857 1753
25 2102 20080 19087
26 2102 7740 7359
27 2102 2679 2530
28 2102 1929 1846
29 2102 2052 1964
30 2102 2374 2247
31 2102 359 343
32 2102 2017 1922
33 2102 933 883
34 2102 3 3
35 2102 14 14
36 2102 3 3
37 2102 9669 9235
38 2102 9264 8768
39 2102 2226 2136
40 2102 3490 3319
41 2102 6269 5985
42 2102 2887 2763
43 2102 1538 1490
44 2102 1257 1182
45 2102 1822 1733
46 2102 6930 6591
47 2102 3428 3236
48 2102 812 777
49 2102 16450 15594
50 2102 10866 10328
51 2102 11574 11089
52 2102 7454 7099
53 2102 3084 2928
54 2102 958 916
55 2102 959 924
56 2102 3216 3063
57 2102 2975 2847
58 2102 423 393
59 2102 1486 1437
60 2102 2226 2114
61 2102 35178 33647
62 2102 15719 14940
63 2102 7213 6875
64 2102 2991 2839
65 2102 3260 3098
66 2102 2911 2794
67 2102 2154 2046
68 2102 2555 2432
69 2102 3318 3154
70 2102 63 58
71 2102 50 48
72 2102 15 14
0 2103 100212 84504
1 2103 2148 2060
2 2103 852 806
3 2103 1510 1437
4 2103 1827 1721
5 2103 3293 3154
6 2103 4981 4775
7 2103 1623 1556
8 2103 724 684
9 2103 1576 1490
10 2103 3469 3306
11 2103 9403 8937
12 2103 240 230
13 2103 32235 30531
14 2103 14888 14341
15 2103 1687 1605
16 2103 1854 1766
17 2103 1986 1879
18 2103 1944 1842
19 2103 950 908
20 2103 2008 1918
21 2103 2229 2103
22 2103 573 553
23 2103 780 738
24 2103 1864 1781
25 2103 20342 19309
26 2103 7921 7544
27 2103 2648 2530
28 2103 1994 1917
29 2103 2072 1972
30 2103 2424 2292
31 2103 446 429
32 2103 2006 1915
33 2103 936 881
34 2103 3 2
35 2103 7 7
36 2103 2 0
37 2103 9801 9317
38 2103 9111 8597
39 2103 2183 2091
40 2103 3333 3188
41 2103 6165 5899
42 2103 2933 2814
43 2103 1547 1459
44 2103 1200 1131
45 2103 1835 1741
46 2103 7160 6849
47 2103 3586 3360
48 2103 866 821
49 2103 16768 15834
50 2103 10968 10386
51 2103 11361 10862
52 2103 7650 7253
53 2103 3120 2960
54 2103 909 869
55 2103 975 930
56 2103 3338 3172
57 2103 2930 2794
58 2103 415 391
59 2103 1511 1429
60 2103 2250 2134
61 2103 35314 33593
62 2103 16083 15237
63 2103 7352 6987
64 2103 2966 2800
65 2103 3205 3029
66 2103 2865 2748
67 2103 2046 1937
68 2103 2735 2615
69 2103 3402 3241
70 2103 59 57
71 2103 52 49
72 2103 10 8
0 2104 101376 86326
1 2104 2159 2067
2 2104 828 792
3 2104 1517 1449
4 2104 1879 1783
5 2104 3294 3151
6 2104 5021 4827
7 2104 1577 1506
8 2104 746 708
9 2104 1539 1455
10 2104 3454 3305
11 2104 9414 8987
12 2104 274 264
13 2104 32595 31014
14 2104 14973 14456
15 2104 1737 1659
16 2104 1740 1674
17 2104 1973 1883
18 2104 1861 1776
19 2104 964 923
20 2104 1873 1782
21 2104 2116 2020
22 2104 600 572
23 2104 761 726
24 2104 1868 1779
25 2104 20151 19214
26 2104 7671 7334
27 2104 2557 2443
28 2104 2050 1964
29 2104 2049 1968
30 2104 2329 2212
31 2104 378 360
32 2104 1931 1830
33 2104 919 871
34 2104 7 7
35 2104 11 10
36 2104 1 1
37 2104 9749 9350
38 2104 9181 8698
39 2104 2189 2092
40 2104 3564 3395
41 2104 6283 6058
42 2104 3006 2896
43 2104 1565 1491
44 2104 1202 1147
45 2104 1795 1712
46 2104 7054 6745
47 2104 3461 3283
48 2104 871 830
49 2104 16441 15625
50 2104 11000 10512
51 2104 11391 10900
52 2104 7708 7348
53 2104 3035 2891
54 2104 906 871
55 2104 934 888
56 2104 3288 3151
57 2104 2925 2804
58 2104 399 384
59 2104 1553 1498
60 2104 2262 2161
61 2104 35226 33783
62 2104 16023 15274
63 2104 7286 6976
64 2104 2970 2825
65 2104 3283 3118
66 2104 2940 2839
67 2104 2096 1998
68 2104 2578 2467
69 2104 3369 3236
70 2104 70 67
71 2104 54 52
72 2104 20 18