################################################### ### chunk number 1: ################################################### library(tgp) library(maptree) ##options(width=65) seed <- 0; set.seed(seed) ################################################### ### chunk number 2: ################################################### library(MASS) out <- btgpllm(X=mcycle[,1], Z=mcycle[,2], bprior="b0", m0r1=TRUE, pred.n=FALSE, verb=0) save(out, file="out.Rsave") out <- NULL ################################################### ### chunk number 3: ################################################### load("out.Rsave") XX <- seq(2.4, 56.7, length=200) out.kp <- predict(out, XX=XX, pred.n=FALSE) ################################################### ### chunk number 4: ################################################### out.p <- predict(out, XX=XX, pred.n=FALSE, BTE=c(0,1000,1)) ################################################### ### chunk number 5: ################################################### out2 <- predict(out, XX, pred.n=FALSE, BTE=c(0,2000,2), krige=FALSE) ################################################### ### chunk number 6: kp ################################################### plot(out.kp, center="km", as="ks2") ################################################### ### chunk number 7: ################################################### rl <- readline("press RETURN to continue: ") graphics.off() ################################################### ### chunk number 8: p ################################################### plot(out.p) ################################################### ### chunk number 9: ################################################### rl <- readline("press RETURN to continue: ") graphics.off() ################################################### ### chunk number 10: 2 ################################################### plot(out2) ################################################### ### chunk number 11: ################################################### rl <- readline("press RETURN to continue: ") graphics.off() ################################################### ### chunk number 12: ################################################### unlink("out.Rsave")