title=Plegando proteínas
date=2005-01-30 14:33
type=post
tags=technology,science
status=published
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featuredcaption=Folding@home banner logo<br /> Source: <a href="https://commons.wikimedia.org/wiki/File:F@H_Logo_2012.png">Wikimedia Commons</a> - <a href="https://en.wikipedia.org/wiki/en:public_domain"><i>Public Domain</i></a>
summary=Muchos conoceréis iniciativas parecidas, como el famoso <b>SETI@home</b> que utiliza mediante computación distribuida ordenadores de todo el mundo para buscar inteligencia extraterrestre analizando la información recibida del espacio
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<p>Muchos conoceréis iniciativas parecidas, como el famoso <a href="http://seti.astroseti.org/setiathome/"><span style="font-weight:bold;">SETI@home</span></a> que utiliza mediante computación distribuida ordenadores de todo el mundo para buscar inteligencia extraterrestre analizando la información recibida del espacio.</p>

<p>Hace unas semanas que participo en una iniciativa parecida. Esta vez se trata de algo más realista (sin menospreciar la búsqueda de inteligencia extraterrestre). El objetivo de <a href="http://folding.stanford.edu/spanish/"><span style="font-weight:bold;">Folding@Home</span></a> consiste en comprender el plegamiento y agregación de las proteínas, y las enfermedades relacionadas.</p>

<p>Tiene además una ventaja. No sólo se puede ejecutar como salvapantallas, puede estar activo constantemente, aprovechando el porcentaje de CPU que tengamos libre. Yo lo tengo puesto en todo momento y no lo noto.</p>

<p>Es muy interesante. Nos permite conocer más datos acerca de la proteína que estamos plegando, así como de los avances que se han logrado hasta ahora. En la página de <a href="http://www.stanford.edu/group/pandegroup/folding/results.html">resultados</a> podemos incluso ver vídeos del proceso.</p>

<blockquote>
 <h4>¿Qué son las proteínas y por qué se "pliegan"?</h4>

 <p>Las proteínas son los <span style="font-weight:bold;">motores de la Biología</span>, sus "nanomáquinas". Para poder desempeñar sus funciones bioquímicas primero se deben auto ensamblar, o "plegarse" de manera increíble. El proceso de plegamiento de las proteínas, que resulta crítico y fundamental virtualmente para toda la Biología, continúa siendo un misterio.</p>

 <p>No sorprende, por tanto, que cuando las proteínas no se pliegan correctamente (es decir, cuando se "mal pliegan"), puedan producirse <span style="font-weight:bold;">consecuencias graves</span>, que incluyen a enfermedades ampliamente conocidas, tales como las enfermedades de <span style="font-weight:bold;">Alzheimer</span>, de la vaca loca ( <span style="font-weight:bold;">Encefalopatía Espongiforme Bovina</span>), de <span style="font-weight:bold;">Creutzfeldt-Jacob</span>, la <span style="font-weight:bold;">Esclerosis Lateral Amiotrófica</span>, y el mal de <span style="font-weight:bold;">Parkinson</span>.</p>

 <h4>¿Qué es Folding@Home?</h4>

 <p>Folding@Home es un proyecto de computación distribuida, que estudia el plegamiento proteico normal y anormal, la agregación proteica y las enfermedades relacionadas. Usamos métodos de cómputo de avanzada y <span style="font-weight:bold;">computación distribuida a gran escala</span>, para simular escalas de tiempo miles a millones de veces mayores que las previamente obtenidas. Esto nos ha permitido simular el plegado proteico por primera vez, y ahora dirigir nuestra investigación al estudio de las enfermedades relacionadas.</p>

 <h4>¿Como puede Ud. colaborar?</h4>

 <p>Ud. Puede colaborar en nuestro proyecto <a href="http://www.stanford.edu/group/pandegroup/folding/spanish/download.html">descargando</a> y empleando nuestro programa cliente. El diseño de nuestros algoritmos hace que, por cada nuevo ordenador que se une al proyecto, obtengamos un incremento importante en la velocidad de simulación.</p>
</blockquote>

<p>Junto a mi hermano <span style="font-weight:bold;">Raúl</span>, hemos creado un equipo "<a href="http://vspx27.stanford.edu/cgi-bin/main.py?qtype=teampage&amp;teamnum=41134"><span style="font-weight:bold;">Spanish Bloggers and friends</span></a>" (Id <span style="font-weight:bold;">41134</span>) para aglutinar el trabajo de todos nosotros, y subir en el ranking de colaboradores. Hagamos que crezca.</p>

<p>La primera <span style="font-style:italic;">Unidad de Trabajo</span> (<span style="font-style:italic;">Work Unit</span>) tarda bastante. Ignoro el motivo, pero el resto avanzan mucho más rápido. Tened paciencia. Y otra cosa, cuando entras en un equipo, no apareces en las estadísticas del mismo hasta que no terminas una <span style="font-style:italic;">WU</span> para ese equipo, tenedlo en cuenta.</p>