| File | Mode | Size |
|---|---|---|
| example | ||
| tests | ||
| CMakeLists.txt | -rw-r--r-- | 6.9 KB |
| LICENSE | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
| README | -rw-r--r-- | 3.5 KB |
| README.mason_frag_sequencing | -rw-r--r-- | 3.9 KB |
| README.mason_genome | -rw-r--r-- | 2.4 KB |
| README.mason_materializer | -rw-r--r-- | 3.4 KB |
| README.mason_methylation | -rw-r--r-- | 4.3 KB |
| README.mason_simulator | -rw-r--r-- | 5.2 KB |
| README.mason_splicing | -rw-r--r-- | 3.6 KB |
| README.mason_variator | -rw-r--r-- | 8.1 KB |
| TODO | -rw-r--r-- | 957 bytes |
| breakpoint_contigs.awk | -rw-r--r-- | 982 bytes |
| external_split_merge.cpp | -rw-r--r-- | 8.2 KB |
| external_split_merge.h | -rw-r--r-- | 12.8 KB |
| fragment_generation.h | -rw-r--r-- | 14.7 KB |
| genomic_variants.cpp | -rw-r--r-- | 44.5 KB |
| genomic_variants.h | -rw-r--r-- | 21.1 KB |
| individual_genome.h | -rw-r--r-- | 6.8 KB |
| mason_frag_sequencing.cpp | -rw-r--r-- | 10.0 KB |
| mason_genome.cpp | -rw-r--r-- | 8.6 KB |
| mason_materializer.cpp | -rw-r--r-- | 10.2 KB |
| mason_methylation.cpp | -rw-r--r-- | 7.1 KB |
| mason_options.cpp | -rw-r--r-- | 85.4 KB |
| mason_options.h | -rw-r--r-- | 32.4 KB |
| mason_simulator.cpp | -rw-r--r-- | 54.2 KB |
| mason_splicing.cpp | -rw-r--r-- | 18.4 KB |
| mason_tests.cpp | -rw-r--r-- | 15.4 KB |
| mason_types.h | -rw-r--r-- | 3.6 KB |
| mason_variator.cpp | -rw-r--r-- | 87.2 KB |
| methylation_levels.cpp | -rw-r--r-- | 5.4 KB |
| methylation_levels.h | -rw-r--r-- | 11.3 KB |
| omp_wrapper.h | -rw-r--r-- | 4.2 KB |
| sequencing.h | -rw-r--r-- | 15.4 KB |
| simulate_454.cpp | -rw-r--r-- | 15.6 KB |
| simulate_base.cpp | -rw-r--r-- | 10.3 KB |
| simulate_genome.cpp | -rw-r--r-- | 4.2 KB |
| simulate_genome.h | -rw-r--r-- | 3.9 KB |
| simulate_illumina.cpp | -rw-r--r-- | 17.8 KB |
| simulate_sanger.cpp | -rw-r--r-- | 11.2 KB |
| variation_size_tsv.h | -rw-r--r-- | 5.3 KB |
| vcf_materialization.cpp | -rw-r--r-- | 24.8 KB |
| vcf_materialization.h | -rw-r--r-- | 7.8 KB |
