https://github.com/lh3/minimap2
Tip revision: f3e59fc2a09e89fdb2c166b6d02281e98288c326 authored by blawrence-ont on 24 January 2024, 17:32:05 UTC
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Tip revision: f3e59fc
| File | Mode | Size |
|---|---|---|
| .github | ||
| lib | ||
| misc | ||
| python | ||
| sse2neon | ||
| test | ||
| tex | ||
| .gitignore | -rw-r--r-- | 58 bytes |
| .gitmodules | -rw-r--r-- | 85 bytes |
| FAQ.md | -rw-r--r-- | 2.0 KB |
| LICENSE.txt | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
| MANIFEST.in | -rw-r--r-- | 216 bytes |
| Makefile | -rw-r--r-- | 4.6 KB |
| Makefile.simde | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
| NEWS.md | -rw-r--r-- | 29.4 KB |
| README.md | -rw-r--r-- | 20.3 KB |
| align.c | -rw-r--r-- | 37.1 KB |
| bseq.c | -rw-r--r-- | 5.2 KB |
| bseq.h | -rw-r--r-- | 1.8 KB |
| code_of_conduct.md | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
| cookbook.md | -rw-r--r-- | 10.2 KB |
| esterr.c | -rw-r--r-- | 1.8 KB |
| example.c | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
| format.c | -rw-r--r-- | 18.9 KB |
| hit.c | -rw-r--r-- | 15.0 KB |
| index.c | -rw-r--r-- | 21.0 KB |
| kalloc.c | -rw-r--r-- | 7.9 KB |
| kalloc.h | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
| kdq.h | -rw-r--r-- | 4.3 KB |
| ketopt.h | -rw-r--r-- | 3.9 KB |
| khash.h | -rw-r--r-- | 20.9 KB |
| krmq.h | -rw-r--r-- | 16.1 KB |
| kseq.h | -rw-r--r-- | 8.6 KB |
| ksort.h | -rw-r--r-- | 5.0 KB |
| ksw2.h | -rw-r--r-- | 8.4 KB |
| ksw2_dispatch.c | -rw-r--r-- | 4.5 KB |
| ksw2_extd2_sse.c | -rw-r--r-- | 17.2 KB |
| ksw2_exts2_sse.c | -rw-r--r-- | 19.2 KB |
| ksw2_extz2_sse.c | -rw-r--r-- | 13.0 KB |
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| kthread.c | -rw-r--r-- | 4.0 KB |
| kthread.h | -rw-r--r-- | 291 bytes |
| kvec.h | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
| lchain.c | -rw-r--r-- | 12.4 KB |
| main.c | -rw-r--r-- | 21.9 KB |
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| minimap.h | -rw-r--r-- | 13.9 KB |
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| options.c | -rw-r--r-- | 8.5 KB |
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| pyproject.toml | -rw-r--r-- | 60 bytes |
| sdust.c | -rw-r--r-- | 6.5 KB |
| sdust.h | -rw-r--r-- | 574 bytes |
| seed.c | -rw-r--r-- | 4.1 KB |
| setup.py | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
| sketch.c | -rw-r--r-- | 5.7 KB |
| splitidx.c | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
README.md
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