| File | Mode | Size |
|---|---|---|
| cram | ||
| htscodecs | ||
| htslib | ||
| m4 | ||
| os | ||
| LICENSE | -rw-r--r-- | 3.5 KB |
| Makefile | -rw-r--r-- | 44.8 KB |
| README | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
| bcf_sr_sort.c | -rw-r--r-- | 22.4 KB |
| bcf_sr_sort.h | -rw-r--r-- | 3.8 KB |
| bgzf.c | -rw-r--r-- | 80.1 KB |
| bgzip.c | -rw-r--r-- | 18.9 KB |
| builddir_vars.mk.in | -rw-r--r-- | 2.4 KB |
| config.h.in | -rw-r--r-- | 4.3 KB |
| config.mk.in | -rw-r--r-- | 3.7 KB |
| configure | -rwxr-xr-x | 205.9 KB |
| configure.ac | -rw-r--r-- | 23.2 KB |
| errmod.c | -rw-r--r-- | 6.6 KB |
| faidx.c | -rw-r--r-- | 28.3 KB |
| header.c | -rw-r--r-- | 78.3 KB |
| header.h | -rw-r--r-- | 10.2 KB |
| hfile.c | -rw-r--r-- | 39.4 KB |
| hfile_gcs.c | -rw-r--r-- | 5.0 KB |
| hfile_internal.h | -rw-r--r-- | 7.9 KB |
| hfile_libcurl.c | -rw-r--r-- | 48.1 KB |
| hfile_s3.c | -rw-r--r-- | 38.9 KB |
| hfile_s3_write.c | -rw-r--r-- | 23.6 KB |
| hts.c | -rw-r--r-- | 158.5 KB |
| hts_expr.c | -rw-r--r-- | 27.7 KB |
| hts_internal.h | -rw-r--r-- | 5.6 KB |
| hts_os.c | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
| hts_time_funcs.h | -rw-r--r-- | 5.7 KB |
| htscodecs_bundled.mk | -rw-r--r-- | 3.6 KB |
| htscodecs_external.mk | -rw-r--r-- | 1.7 KB |
| htsfile.c | -rw-r--r-- | 9.4 KB |
| htslib.mk | -rw-r--r-- | 6.7 KB |
| htslib.pc.in | -rw-r--r-- | 490 bytes |
| htslib_vars.mk | -rw-r--r-- | 3.3 KB |
| kfunc.c | -rw-r--r-- | 10.6 KB |
| kstring.c | -rw-r--r-- | 10.3 KB |
| md5.c | -rw-r--r-- | 10.4 KB |
| multipart.c | -rw-r--r-- | 8.3 KB |
| plugin.c | -rw-r--r-- | 6.4 KB |
| probaln.c | -rw-r--r-- | 16.9 KB |
| realn.c | -rw-r--r-- | 12.9 KB |
| regidx.c | -rw-r--r-- | 19.4 KB |
| region.c | -rw-r--r-- | 7.6 KB |
| sam.c | -rw-r--r-- | 190.3 KB |
| sam_internal.h | -rw-r--r-- | 3.4 KB |
| sam_mods.c | -rw-r--r-- | 24.6 KB |
| synced_bcf_reader.c | -rw-r--r-- | 47.5 KB |
| tabix.c | -rw-r--r-- | 25.7 KB |
| tbx.c | -rw-r--r-- | 15.8 KB |
| textutils.c | -rw-r--r-- | 11.7 KB |
| textutils_internal.h | -rw-r--r-- | 14.5 KB |
| thread_pool.c | -rw-r--r-- | 44.7 KB |
| thread_pool_internal.h | -rw-r--r-- | 5.7 KB |
| vcf.c | -rw-r--r-- | 178.1 KB |
| vcf_sweep.c | -rw-r--r-- | 5.4 KB |
| vcfutils.c | -rw-r--r-- | 34.1 KB |
| version.sh | -rwxr-xr-x | 2.2 KB |
