https://github.com/PeterUlz/FocalAmplifications
Tip revision: 71e742197f734d6316332857849d81eff4925381 authored by PeterUlz on 20 May 2016, 11:04:52 UTC
Update README.md
Update README.md
Tip revision: 71e7421
P125_1.segments
Chromosome Start End Log2Ratio
chr1 0 35344131 -0.111902713178755
chr1 35344132 57008248 -0.0717721097978964
chr1 57008249 62611517 -0.0166550218847456
chr1 62611518 78757572 -0.0779640583502846
chr1 78757573 79208892 -0.1316968062849
chr1 79208893 106465654 -0.178570639534073
chr1 106465655 108666422 -0.270410249565682
chr1 108666423 109319255 -0.149739495599637
chr1 109319256 110622179 -0.0518498026479302
chr1 110622180 112204532 -0.205328515457313
chr1 112204533 112374022 -0.115005479513066
chr1 112374023 149043990 0.00220697014216962
chr1 149043991 149345089 -0.52493541170915
chr1 149345090 149572044 -0.222188083868436
chr1 149572045 166284736 0.0476682874195727
chr1 166284737 166397555 -0.0807197005150098
chr1 166397556 169619006 -0.21727933026414
chr1 169619007 169675385 0.00271230030355434
chr1 169675386 172619309 0.209402768381629
chr1 172619310 172788678 0.099895437805199
chr1 172788679 173243775 -0.108930179022571
chr1 173243776 188777239 -0.229336059389009
chr1 188777240 192448846 -0.161703909707835
chr1 192448847 193468251 -0.239015508431681
chr1 193468252 198182085 0.096398440478276
chr1 198182086 212575023 0.0160062437082616
chr1 212575024 213706254 -0.120839819222161
chr1 213706255 249178441 0.0149212961268175
chr2 0 24021061 -0.169814041187261
chr2 24021062 28706976 -0.111769073679931
chr2 28706977 49178011 -0.160368601800194
chr2 49178012 49687583 -0.0750963085751094
chr2 49687584 80707907 0.007325436010084
chr2 80707908 83703133 0.0865704294322736
chr2 83703134 106032030 0.00124058228249514
chr2 106032031 106999774 0.10858158967169
chr2 106999775 108968289 -0.0089493048813176
chr2 108968290 109545459 -0.102665144725294
chr2 109545460 111581599 -0.216268930594426
chr2 111581600 113583112 -0.109313468043853
chr2 113583113 114090798 -0.221698936365094
chr2 114090799 118102773 -0.103692436976449
chr2 118102774 125473983 -0.165236441926536
chr2 125473984 143708975 -0.207600427864339
chr2 143708976 146086784 -0.136962691420603
chr2 146086785 148457251 -0.0263908279095466
chr2 148457252 172985200 0.0278872660701856
chr2 172985201 216250061 0.0654849075586384
chr2 216250062 218902389 -0.0187235375947868
chr2 218902390 234563552 0.0499431250198963
chr2 234563553 243052394 6.52060479003659e-05
chr3 0 1532830 -0.0739012668842978
chr3 1532831 1873094 0.0897541165383552
chr3 1873095 3172096 -0.0649772252564165
chr3 3172097 7874227 -0.090529651928811
chr3 7874228 14934744 -0.124394658535277
chr3 14934745 27683603 -0.0779926068441187
chr3 27683604 44205507 -0.133446621171626
chr3 44205508 51948306 -0.0852308486956919
chr3 51948307 52061002 -0.459253227234723
chr3 52061003 74437461 -0.0898778878286599
chr3 74437462 74493807 -0.0506119633401654
chr3 74493808 162514872 -0.00211742982600604
chr3 162514873 162627562 0.97908293998563
chr3 162627563 169876603 0.0275247964426819
chr3 169876604 195982050 -0.0372959120781847
chr3 195982051 196603800 0.111670312329442
chr3 196603801 197458853 -0.041457850013903
chr3 197458854 197857588 0.0545071397773136
chr4 0 9202235 -0.0762411670648945
chr4 9202236 48221323 -0.00647955886752542
chr4 48221324 48334518 -0.0439250258816388
chr4 48334519 49073139 -0.102907069852216
chr4 49073140 49196084 -0.439668294140212
chr4 49196085 61185673 -0.120809198400865
chr4 61185674 68719339 -0.0470450077109885
chr4 68719340 116908641 -0.102826386269777
chr4 116908642 126229380 -0.0647771435071233
chr4 126229381 127189169 0.0114830828248085
chr4 127189170 147377824 0.0658271321223003
chr4 147377825 150489994 0.0125485744033615
chr4 150489995 152189322 -0.102357529604852
chr4 152189323 190955048 -0.174653709308858
chr5 0 6651887 -0.0492705416948889
chr5 6651888 6708224 -0.18024669848796
chr5 6708225 32043969 -0.311880047708934
chr5 32043970 32100306 -0.172259886349469
chr5 32100307 36946136 -0.0232161215064549
chr5 36946137 37851836 0.0816103395006008
chr5 37851837 49648422 -0.0164844916241816
chr5 49648423 57285796 -0.313837704494981
chr5 57285797 58253604 -0.153557213591424
chr5 58253605 81401110 -0.318973004616587
chr5 81401111 81515411 -0.17460209072661
chr5 81515412 83785731 -0.0402439141671537
chr5 83785732 83842068 -0.17938395881465
chr5 83842069 98323275 -0.315064352794929
chr5 98323276 98436126 -0.193808378777186
chr5 98436127 118911150 -0.0569405584756587
chr5 118911151 143462369 -0.106036766611513
chr5 143462370 160176230 -0.0572285699037
chr5 160176231 167359634 -0.00689743469958921
chr5 167359635 176967776 -0.0715808668212701
chr5 176967777 178964388 -0.158045552054747
chr5 178964389 180730344 -0.0829878999547568
chr6 0 17018498 -0.285677629377598
chr6 17018499 17131204 -0.13110056990837
chr6 17131205 32483026 0.024076534954399
chr6 32483027 32652484 -1.8699419175842
chr6 32652485 41514868 -0.0483179495276463
chr6 41514869 56000895 -0.00355344442571931
chr6 56000896 56793638 -0.0817352042317179
chr6 56793639 57360270 0.0742464887693298
chr6 57360271 67158598 0.171179492396801
chr6 67158599 67385514 0.0812712427527965
chr6 67385515 170939734 -0.0101754260288906
chr7 0 8730900 0.26336020964324
chr7 8730901 14560227 0.325318443429983
chr7 14560228 15522167 0.266312431116513
chr7 15522168 97212748 0.176482832129653
chr7 97212749 108710537 0.13731891630246
chr7 108710538 118635291 0.172517681495971
chr7 118635292 118973947 0.125369718215835
chr7 118973948 159071691 0.0767160823454835
chr8 0 2434859 -0.278628279194227
chr8 2434860 3958440 -0.158925920343322
chr8 3958441 7136079 -0.259087614609347
chr8 7136080 8072632 -0.109862819658083
chr8 8072633 11928142 -0.260114849100526
chr8 11928143 18605674 -0.190060649843055
chr8 18605675 21314926 -0.28569304609938
chr8 21314927 37490129 -0.217932773628513
chr8 37490130 38336110 -0.109063725230222
chr8 38336111 39238450 -0.228293220855311
chr8 39238451 39351613 0.194441763703088
chr8 39351614 47123711 -0.228094119851072
chr8 47123712 47236442 -0.0742925221456205
chr8 47236443 67491757 0.0776615219935747
chr8 67491758 69645289 0.157905076905763
chr8 69645290 75992578 0.531627088526491
chr8 75992579 80864330 0.588569163754793
chr8 80864331 82675289 0.483562608083822
chr8 82675290 87343156 0.576113810015201
chr8 87343157 88421079 0.613392998774249
chr8 88421080 88535768 1.00542959484759
chr8 88535769 94043558 0.643641748041181
chr8 94043559 94156335 0.458464480517413
chr8 94156336 102206576 0.579863750332073
chr8 102206577 102717322 0.459782895673911
chr8 102717323 114765880 0.587169878986925
chr8 114765881 114822572 0.467936632174458
chr8 114822573 115905152 0.270174823684503
chr8 115905153 146247376 0.180907479402716
chr9 0 28402965 -0.0683553623221173
chr9 28402966 44762054 -0.0206337439218532
chr9 44762055 44882887 -1.13645191748601
chr9 44882888 87757653 -0.00642916025853705
chr9 87757654 117974574 -0.0362188443556287
chr9 117974575 122156617 0.0112916875513161
chr9 122156618 141063187 -0.0647309617493044
chr10 0 6068605 -0.0579260165963249
chr10 6068606 6525792 -0.21058079338168
chr10 6525793 30193746 -0.0378297997550494
chr10 30193747 31267755 -0.161019012358472
chr10 31267756 35342779 -0.0546556042744295
chr10 35342780 36418449 0.00346626899978834
chr10 36418450 55470899 0.070569183886214
chr10 55470900 59546946 0.157760100252295
chr10 59546947 71075234 0.0801209653367975
chr10 71075235 71187931 0.019751153637369
chr10 71187932 71356977 -0.0821499320719713
chr10 71356978 71751423 -0.1732171288584
chr10 71751424 72316083 -0.0221626281723257
chr10 72316084 73501233 -0.169276013125097
chr10 73501234 75596150 -0.0761766570685015
chr10 75596151 81365210 -0.175455955878851
chr10 81365211 89235172 -0.0828336824735808
chr10 89235173 90762602 -0.623921158155621
chr10 90762603 96362570 -0.17518450642205
chr10 96362571 105193508 -0.0857144556239646
chr10 105193509 106322344 -0.197848734029633
chr10 106322345 113924206 -0.0550274548269708
chr10 113924207 120592626 -0.102496944569817
chr10 120592627 121778180 -0.041613075602563
chr10 121778181 129679446 -0.120433205202106
chr10 129679447 129848492 -0.378603795121596
chr10 129848493 135438600 -0.128377203020619
chr11 0 17399616 -0.0761494315131725
chr11 17399617 17681370 -0.27167671549779
chr11 17681371 19434963 -0.118431291643737
chr11 19434964 20168916 -0.042610680838756
chr11 20168917 37446027 0.00758900426344667
chr11 37446028 42366174 0.0702808048990285
chr11 42366175 44518549 0.0293909416316427
chr11 44518550 45082621 -0.115573164265039
chr11 45082622 45478457 -0.039013892271521
chr11 45478458 58618225 0.0359342968495919
chr11 58618226 80851194 0.0067781138730903
chr11 80851195 86226904 0.0503281667971666
chr11 86226905 97948484 -0.023521528365723
chr11 97948485 115104734 0.0520339243155068
chr11 115104735 115781672 -0.00187329872637618
chr11 115781673 134889487 -0.0908150579688045
chr12 0 20282779 -0.122457132902685
chr12 20282780 25042420 0.144006466816119
chr12 25042421 25721765 0.0792237777190258
chr12 25721766 25891450 -0.0243290798562
chr12 25891451 31891716 -0.147392086038161
chr12 31891717 38568378 -0.08710540230969
chr12 38568379 44696257 -0.00874542289954618
chr12 44696258 46394345 -0.0650963737952743
chr12 46394346 50634057 -0.128071653489522
chr12 50634058 80656881 -0.0618329782785387
chr12 80656882 80943137 0.012046620282721
chr12 80943138 105162406 0.0960837043258063
chr12 105162407 105614238 0.0212384588797521
chr12 105614239 133784555 -0.0550476493193634
chr13 0 20930001 0.115471863641572
chr13 20930002 21437561 0.278192751189937
chr13 21437562 23866632 0.16967662205538
chr13 23866633 24092460 0.253391652517498
chr13 24092461 32121857 0.0921633784159154
chr13 32121858 32178665 -0.0756062700964097
chr13 32178666 55421592 -0.217778415213734
chr13 55421593 58272775 -0.144058186963764
chr13 58272776 115053231 -0.21855089768025
chr14 0 55101209 0.0600527446459333
chr14 55101210 56116250 -0.0499979717084824
chr14 56116251 61498922 0.211285713288403
chr14 61498923 61559724 -0.0269793353215425
chr14 61559725 73432992 -0.264281975753962
chr14 73432993 107232714 0.200558906242995
chr15 0 20244462 -0.140929409297442
chr15 20244463 22656223 -0.278934738958372
chr15 22656224 53581204 -0.134154593204573
chr15 53581205 54997654 -0.19181857374115
chr15 54997655 83822440 -0.241978488077643
chr15 83822441 84048330 -0.173548403636761
chr15 84048331 102435472 -0.1046711506774
chr16 0 15778293 0.110335151583576
chr16 15778294 28285318 0.0569561316238322
chr16 28285319 35235748 0.0991989417088653
chr16 35235749 49121229 -0.225088736899203
chr16 49121230 57546669 -0.296458569045236
chr16 57546670 71164749 -0.24085773199194
chr16 71164750 77406554 -0.326662820983029
chr16 77406555 78026674 -0.481544661010034
chr16 78026675 83445486 -0.321017346577372
chr16 83445487 90173456 -0.281212437256924
chr17 0 12447336 -0.183933244925379
chr17 12447337 20386107 -0.24336392491602
chr17 20386108 22154520 -0.188237146556567
chr17 22154521 25271509 -0.0942813903305802
chr17 25271510 37571479 0.0100154492819417
chr17 37571480 44392868 -0.0621428268636922
chr17 44392869 44769626 0.833529863165043
chr17 44769627 46479733 -0.13985812950349
chr17 46479734 72357504 -0.197479501279667
chr17 72357505 81118590 -0.157658382883063
chr18 0 418610 0.0629215826747492
chr18 418611 18760318 0.141672181367558
chr18 18760319 19211475 0.00107621664670643
chr18 19211476 31709312 -0.109487920381429
chr18 31709313 52576390 -0.161387665533035
chr18 52576391 53027379 -0.235258453162859
chr18 53027380 77960362 -0.330197015484874
chr19 0 8833267 0.0143367669481705
chr19 8833268 28537746 0.0562353061824456
chr19 28537747 32666066 -0.0233125540170291
chr19 32666067 59054950 0.0344895524296799
chr20 0 33197630 -0.100005940726147
chr20 33197631 33818619 0.07008077867711
chr20 33818620 52286423 -0.109263207624289
chr20 52286424 55398954 -0.0406521133584005
chr20 55398955 62895415 -0.13152765504904
chr21 0 35202341 -0.00240477991167133
chr21 35202342 38192997 -0.0703389289690399
chr21 38192998 39489812 0.0041005361238061
chr21 39489813 39603107 -0.117937874240589
chr21 39603108 45010301 -0.194936348179345
chr21 45010302 48055817 -0.113650306722664
chr22 0 25656936 -0.202921592531972
chr22 25656937 25885001 0.546284385548516
chr22 25885002 25941946 0.146620609294846
chr22 25941947 28932648 -0.225081762575378
chr22 28932649 29332195 -0.0711524144348572
chr22 29332196 40170244 -0.224791302943191
chr22 40170245 41245358 -0.115048817652749
chr22 41245359 51176570 -0.215741415028038
chrX 0 2677955 -0.0722095492774189
chrX 2677956 21928636 0.0607676912256638
chrX 21928637 22041359 -0.348155724282488
chrX 22041360 65934568 0.0709246356560884
chrX 65934569 66047998 0.351935211014456
chrX 66047999 68147552 0.636659935690347
chrX 68147553 155197903 -0.20001014568952
chrY 0 58977233 -0.60132319896076