https://github.com/satijalab/seurat
Tip revision: 07188a998f0f1da8f671aa614cb72c249c9b0a94 authored by Andrew Butler on 23 August 2016, 01:33:56 UTC
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Tip revision: 07188a9
File | Mode | Size |
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AddSamples.Rd | -rw-r--r-- | 740 bytes |
AddSmoothedScore.Rd | -rw-r--r-- | 990 bytes |
AverageExpression.Rd | -rw-r--r-- | 844 bytes |
AveragePCA.Rd | -rw-r--r-- | 408 bytes |
BatchGene.Rd | -rw-r--r-- | 917 bytes |
BuildSNN.Rd | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
ClusterAlpha.Rd | -rw-r--r-- | 513 bytes |
DBClustDimension.Rd | -rw-r--r-- | 1.0 KB |
DiffExpTest.Rd | -rw-r--r-- | 1022 bytes |
DiffTTest.Rd | -rw-r--r-- | 983 bytes |
DimPlot.Rd | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
DotPlot.Rd | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
FeatureHeatmap.Rd | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
FeaturePlot.Rd | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
FetchData.Rd | -rw-r--r-- | 798 bytes |
FindAllMarkers.Rd | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
FindClusters.Rd | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
FindMarkers.Rd | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
FindMarkersNode.Rd | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
FitGeneK.Rd | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
GetCentroids.Rd | -rw-r--r-- | 795 bytes |
ICAPlot.Rd | -rw-r--r-- | 529 bytes |
InitialMapping.Rd | -rw-r--r-- | 571 bytes |
KClustDimension.Rd | -rw-r--r-- | 532 bytes |
LogNormalize.Rd | -rw-r--r-- | 462 bytes |
MarkerTest.Rd | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
MeanVarPlot.Rd | -rw-r--r-- | 3.2 KB |
PCAFast.Rd | -rw-r--r-- | 967 bytes |
PCAPlot.Rd | -rw-r--r-- | 529 bytes |
PCASigGenes.Rd | -rw-r--r-- | 862 bytes |
PCElbowPlot.Rd | -rw-r--r-- | 580 bytes |
PCTopCells.Rd | -rw-r--r-- | 601 bytes |
PrintPCA.Rd | -rw-r--r-- | 590 bytes |
ProjectPCA.Rd | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
Read10X.Rd | -rw-r--r-- | 454 bytes |
RefinedMapping.Rd | -rw-r--r-- | 724 bytes |
RegressOut.Rd | -rw-r--r-- | 676 bytes |
RenameIdent.Rd | -rw-r--r-- | 578 bytes |
ReorderIdent.Rd | -rw-r--r-- | 1002 bytes |
RunDiffusion.Rd | -rw-r--r-- | 1.8 KB |
RunTSNE.Rd | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
ScaleData.Rd | -rw-r--r-- | 926 bytes |
SetAllIdent.Rd | -rw-r--r-- | 607 bytes |
SetIdent.Rd | -rw-r--r-- | 586 bytes |
Seurat-deprecated.Rd | -rw-r--r-- | 8.2 KB |
StashIdent.Rd | -rw-r--r-- | 603 bytes |
SubsetCells.Rd | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
TSNEPlot.Rd | -rw-r--r-- | 974 bytes |
TobitTest.Rd | -rw-r--r-- | 1.0 KB |
ValidateClusters.Rd | -rw-r--r-- | 958 bytes |
ValidateSpecificClusters.Rd | -rw-r--r-- | 953 bytes |
VizICA.Rd | -rw-r--r-- | 732 bytes |
VizPCA.Rd | -rw-r--r-- | 824 bytes |
WhichCells.Rd | -rw-r--r-- | 552 bytes |
addImputedScore.Rd | -rw-r--r-- | 945 bytes |
addMetaData.Rd | -rw-r--r-- | 979 bytes |
buildClusterTree.Rd | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
cellPlot.Rd | -rw-r--r-- | 1.0 KB |
doHeatMap.Rd | -rw-r--r-- | 2.0 KB |
doKMeans.Rd | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
genePlot.Rd | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
icHeatmap.Rd | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
icTopGenes.Rd | -rw-r--r-- | 605 bytes |
ica.Rd | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
jackStraw.Rd | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
jackStrawPlot.Rd | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
pcHeatmap.Rd | -rw-r--r-- | 1.8 KB |
pcTopGenes.Rd | -rw-r--r-- | 690 bytes |
pca.Rd | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
plotClusterTree.Rd | -rw-r--r-- | 416 bytes |
plotNoiseModel.Rd | -rw-r--r-- | 821 bytes |
setup.Rd | -rw-r--r-- | 1.7 KB |
seurat.Rd | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
subsetData.Rd | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
vlnPlot.Rd | -rw-r--r-- | 1.5 KB |