https://github.com/lh3/minimap2
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Tip revision: 8170693de39b667d11c8931d343c94a23a7690d2 authored by Heng Li on 27 March 2024, 14:57:17 UTC
Release minimap2-2.28 (r1209)
Tip revision: 8170693
File Mode Size
.github
lib
misc
python
sse2neon
test
tex
.gitignore -rw-r--r-- 58 bytes
.gitmodules -rw-r--r-- 85 bytes
FAQ.md -rw-r--r-- 2.0 KB
LICENSE.txt -rw-r--r-- 1.1 KB
MANIFEST.in -rw-r--r-- 216 bytes
Makefile -rw-r--r-- 4.6 KB
Makefile.simde -rw-r--r-- 3.0 KB
NEWS.md -rw-r--r-- 31.7 KB
README.md -rw-r--r-- 20.2 KB
align.c -rw-r--r-- 37.2 KB
bseq.c -rw-r--r-- 5.2 KB
bseq.h -rw-r--r-- 1.8 KB
code_of_conduct.md -rw-r--r-- 1.4 KB
cookbook.md -rw-r--r-- 10.2 KB
esterr.c -rw-r--r-- 1.8 KB
example.c -rw-r--r-- 2.1 KB
format.c -rw-r--r-- 20.9 KB
hit.c -rw-r--r-- 15.0 KB
index.c -rw-r--r-- 21.0 KB
kalloc.c -rw-r--r-- 7.9 KB
kalloc.h -rw-r--r-- 2.6 KB
kdq.h -rw-r--r-- 4.3 KB
ketopt.h -rw-r--r-- 3.9 KB
khash.h -rw-r--r-- 20.9 KB
krmq.h -rw-r--r-- 16.1 KB
kseq.h -rw-r--r-- 8.6 KB
ksort.h -rw-r--r-- 5.0 KB
ksw2.h -rw-r--r-- 8.4 KB
ksw2_dispatch.c -rw-r--r-- 4.5 KB
ksw2_extd2_sse.c -rw-r--r-- 17.2 KB
ksw2_exts2_sse.c -rw-r--r-- 19.2 KB
ksw2_extz2_sse.c -rw-r--r-- 13.0 KB
ksw2_ll_sse.c -rw-r--r-- 4.5 KB
kthread.c -rw-r--r-- 4.0 KB
kthread.h -rw-r--r-- 291 bytes
kvec.h -rw-r--r-- 3.0 KB
lchain.c -rw-r--r-- 12.6 KB
main.c -rw-r--r-- 22.4 KB
map.c -rw-r--r-- 27.4 KB
minimap.h -rw-r--r-- 14.0 KB
minimap2.1 -rw-r--r-- 20.7 KB
misc.c -rw-r--r-- 4.3 KB
mmpriv.h -rw-r--r-- 6.2 KB
options.c -rw-r--r-- 8.9 KB
pe.c -rw-r--r-- 5.6 KB
pyproject.toml -rw-r--r-- 60 bytes
sdust.c -rw-r--r-- 6.5 KB
sdust.h -rw-r--r-- 574 bytes
seed.c -rw-r--r-- 4.1 KB
setup.py -rw-r--r-- 1.9 KB
sketch.c -rw-r--r-- 5.7 KB
splitidx.c -rw-r--r-- 2.1 KB

README.md

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