Revision 364450551a2b10379ffdb5d8fbb1678107ebb9ed authored by Andreas Heger on 10 January 2019, 22:35:44 UTC, committed by GitHub on 10 January 2019, 22:35:44 UTC
Remove deprecated sudo: false from .travis.yml
2 parent s 2d30332 + bfe3c73
History
File Mode Size
htslib-1.9
plugins
test
HMM.c -rw-r--r-- 17.8 KB
HMM.c.pysam.c -rw-r--r-- 17.8 KB
HMM.h -rw-r--r-- 4.9 KB
LICENSE -rw-r--r-- 36.6 KB
README -rw-r--r-- 246 bytes
bam2bcf.c -rw-r--r-- 31.6 KB
bam2bcf.c.pysam.c -rw-r--r-- 31.7 KB
bam2bcf.h -rw-r--r-- 5.0 KB
bam2bcf_indel.c -rw-r--r-- 21.4 KB
bam2bcf_indel.c.pysam.c -rw-r--r-- 21.5 KB
bam_sample.c -rw-r--r-- 13.4 KB
bam_sample.c.pysam.c -rw-r--r-- 13.4 KB
bam_sample.h -rw-r--r-- 2.0 KB
bcftools.h -rw-r--r-- 3.1 KB
bcftools.pysam.c -rw-r--r-- 1.5 KB
bcftools.pysam.h -rw-r--r-- 1021 bytes
bin.c -rw-r--r-- 3.3 KB
bin.c.pysam.c -rw-r--r-- 3.3 KB
bin.h -rw-r--r-- 2.1 KB
call.h -rw-r--r-- 4.6 KB
ccall.c -rw-r--r-- 12.9 KB
ccall.c.pysam.c -rw-r--r-- 12.9 KB
consensus.c -rw-r--r-- 33.7 KB
consensus.c.pysam.c -rw-r--r-- 34.1 KB
convert.c -rw-r--r-- 53.0 KB
convert.c.pysam.c -rw-r--r-- 53.1 KB
convert.h -rw-r--r-- 1.7 KB
csq.c -rw-r--r-- 149.9 KB
csq.c.pysam.c -rw-r--r-- 150.5 KB
em.c -rw-r--r-- 8.6 KB
em.c.pysam.c -rw-r--r-- 8.7 KB
filter.c -rw-r--r-- 105.6 KB
filter.c.pysam.c -rw-r--r-- 105.7 KB
filter.h -rw-r--r-- 1.9 KB
gvcf.c -rw-r--r-- 7.9 KB
gvcf.c.pysam.c -rw-r--r-- 7.9 KB
gvcf.h -rw-r--r-- 1.5 KB
hclust.c -rw-r--r-- 12.4 KB
hclust.c.pysam.c -rw-r--r-- 12.5 KB
hclust.h -rw-r--r-- 2.7 KB
khash_str2str.h -rw-r--r-- 3.1 KB
kheap.h -rw-r--r-- 7.5 KB
kmin.c -rw-r--r-- 7.1 KB
kmin.c.pysam.c -rw-r--r-- 7.1 KB
kmin.h -rw-r--r-- 1.6 KB
main.c -rw-r--r-- 8.7 KB
main.c.pysam.c -rw-r--r-- 8.8 KB
mcall.c -rw-r--r-- 57.7 KB
mcall.c.pysam.c -rw-r--r-- 57.8 KB
mpileup.c -rw-r--r-- 47.5 KB
mpileup.c.pysam.c -rw-r--r-- 47.9 KB
mw.h -rw-r--r-- 60.8 KB
ploidy.c -rw-r--r-- 7.9 KB
ploidy.c.pysam.c -rw-r--r-- 8.0 KB
ploidy.h -rw-r--r-- 4.3 KB
prob1.c -rw-r--r-- 20.0 KB
prob1.c.pysam.c -rw-r--r-- 20.1 KB
prob1.h -rw-r--r-- 3.5 KB
rbuf.h -rw-r--r-- 7.4 KB
regidx.c -rw-r--r-- 17.9 KB
regidx.c.pysam.c -rw-r--r-- 18.0 KB
regidx.h -rw-r--r-- 7.5 KB
reheader.c -rw-r--r-- 18.1 KB
reheader.c.pysam.c -rw-r--r-- 18.2 KB
smpl_ilist.c -rw-r--r-- 3.4 KB
smpl_ilist.c.pysam.c -rw-r--r-- 3.5 KB
smpl_ilist.h -rw-r--r-- 1.7 KB
tabix.c -rw-r--r-- 5.6 KB
tabix.c.pysam.c -rw-r--r-- 5.8 KB
tsv2vcf.c -rw-r--r-- 3.5 KB
tsv2vcf.c.pysam.c -rw-r--r-- 3.6 KB
tsv2vcf.h -rw-r--r-- 2.6 KB
vcfannotate.c -rw-r--r-- 97.3 KB
vcfannotate.c.pysam.c -rw-r--r-- 97.6 KB
vcfbuf.c -rw-r--r-- 12.9 KB
vcfbuf.c.pysam.c -rw-r--r-- 12.9 KB
vcfbuf.h -rw-r--r-- 2.7 KB
vcfcall.c -rw-r--r-- 34.5 KB
vcfcall.c.pysam.c -rw-r--r-- 35.0 KB
vcfcnv.c -rw-r--r-- 56.5 KB
vcfcnv.c.pysam.c -rw-r--r-- 57.0 KB
vcfconcat.c -rw-r--r-- 35.6 KB
vcfconcat.c.pysam.c -rw-r--r-- 35.9 KB
vcfconvert.c -rw-r--r-- 60.0 KB
vcfconvert.c.pysam.c -rw-r--r-- 60.9 KB
vcffilter.c -rw-r--r-- 22.6 KB
vcffilter.c.pysam.c -rw-r--r-- 22.8 KB
vcfgtcheck.c -rw-r--r-- 33.1 KB
vcfgtcheck.c.pysam.c -rw-r--r-- 33.3 KB
vcfindex.c -rw-r--r-- 8.4 KB
vcfindex.c.pysam.c -rw-r--r-- 8.7 KB
vcfisec.c -rw-r--r-- 24.7 KB
vcfisec.c.pysam.c -rw-r--r-- 25.1 KB
vcfmerge.c -rw-r--r-- 95.0 KB
vcfmerge.c.pysam.c -rw-r--r-- 95.5 KB
vcfnorm.c -rw-r--r-- 78.3 KB
vcfnorm.c.pysam.c -rw-r--r-- 78.6 KB
vcfplugin.c -rw-r--r-- 21.0 KB
vcfplugin.c.pysam.c -rw-r--r-- 21.5 KB
vcfquery.c -rw-r--r-- 15.2 KB
vcfquery.c.pysam.c -rw-r--r-- 15.4 KB
vcfroh.c -rw-r--r-- 48.5 KB
vcfroh.c.pysam.c -rw-r--r-- 49.0 KB
vcfsom.c -rw-r--r-- 23.3 KB
vcfsom.c.pysam.c -rw-r--r-- 23.6 KB
vcfsort.c -rw-r--r-- 9.3 KB
vcfsort.c.pysam.c -rw-r--r-- 9.4 KB
vcfstats.c -rw-r--r-- 70.7 KB
vcfstats.c.pysam.c -rw-r--r-- 73.5 KB
vcfview.c -rw-r--r-- 34.9 KB
vcfview.c.pysam.c -rw-r--r-- 35.4 KB
vcmp.c -rw-r--r-- 4.4 KB
vcmp.c.pysam.c -rw-r--r-- 4.4 KB
vcmp.h -rw-r--r-- 2.4 KB
version.c -rw-r--r-- 1.9 KB
version.c.pysam.c -rw-r--r-- 1.9 KB
version.h -rw-r--r-- 31 bytes

README

back to top