https://github.com/PublicHealthDynamicsLab/FRED
Revision a45e04ad99c865724a3c2b1a2d3fd979b3c6be88 authored by John Grefenstette on 07 January 2016, 16:32:02 UTC, committed by John Grefenstette on 07 January 2016, 16:32:02 UTC
1 parent 9bc2dce
Tip revision: a45e04ad99c865724a3c2b1a2d3fd979b3c6be88 authored by John Grefenstette on 07 January 2016, 16:32:02 UTC
working markov epidemic model
working markov epidemic model
Tip revision: a45e04a
| File | Mode | Size |
|---|---|---|
| TestSuite | ||
| AV_Decisions.cc | -rw-r--r-- | 2.3 KB |
| AV_Decisions.h | -rw-r--r-- | 2.0 KB |
| AV_Health.cc | -rw-r--r-- | 1.7 KB |
| AV_Health.h | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
| AV_Manager.cc | -rw-r--r-- | 3.6 KB |
| AV_Manager.h | -rw-r--r-- | 2.9 KB |
| AV_Policies.cc | -rw-r--r-- | 2.0 KB |
| AV_Policies.h | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
| Abstract_Grid.cc | -rw-r--r-- | 363 bytes |
| Abstract_Grid.h | -rw-r--r-- | 2.8 KB |
| Abstract_Patch.cc | -rw-r--r-- | 364 bytes |
| Abstract_Patch.h | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
| Activities.cc | -rw-r--r-- | 92.4 KB |
| Activities.h | -rw-r--r-- | 18.3 KB |
| Age_Map.cc | -rw-r--r-- | 4.6 KB |
| Age_Map.h | -rw-r--r-- | 3.2 KB |
| Antiviral.cc | -rw-r--r-- | 7.8 KB |
| Antiviral.h | -rw-r--r-- | 8.7 KB |
| Antivirals.cc | -rw-r--r-- | 4.2 KB |
| Antivirals.h | -rw-r--r-- | 3.2 KB |
| Behavior.cc | -rw-r--r-- | 19.3 KB |
| Behavior.h | -rw-r--r-- | 4.1 KB |
| Bloque.h | -rw-r--r-- | 16.4 KB |
| Classroom.cc | -rw-r--r-- | 4.7 KB |
| Classroom.h | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
| Compression.cc | -rw-r--r-- | 8.3 KB |
| Compression.h | -rw-r--r-- | 2.3 KB |
| County.cc | -rw-r--r-- | 35.7 KB |
| County.h | -rw-r--r-- | 4.7 KB |
| Date.cc | -rw-r--r-- | 5.8 KB |
| Date.h | -rw-r--r-- | 4.3 KB |
| Decision.cc | -rw-r--r-- | 604 bytes |
| Decision.h | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
| Demographics.cc | -rw-r--r-- | 19.8 KB |
| Demographics.h | -rw-r--r-- | 6.0 KB |
| Disease.cc | -rw-r--r-- | 11.4 KB |
| Disease.h | -rw-r--r-- | 5.3 KB |
| Disease_List.cc | -rw-r--r-- | 2.4 KB |
| Disease_List.h | -rw-r--r-- | 997 bytes |
| Epidemic.cc | -rw-r--r-- | 70.0 KB |
| Epidemic.h | -rw-r--r-- | 9.7 KB |
| Events.cc | -rw-r--r-- | 2.5 KB |
| Events.h | -rw-r--r-- | 1017 bytes |
| Evolution.cc | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
| Evolution.h | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
| EvolutionFactory.cc | -rw-r--r-- | 730 bytes |
| EvolutionFactory.h | -rw-r--r-- | 900 bytes |
| FRED.md5 | -rw-r--r-- | 33 bytes |
| FRED.tar.gz | -rw-r--r-- | 238.0 KB |
| FixedIntraHost.cc | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
| FixedIntraHost.h | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
| Fred.cc | -rw-r--r-- | 17.1 KB |
| Fred.h | -rw-r--r-- | 535 bytes |
| Geo.cc | -rw-r--r-- | 3.1 KB |
| Geo.h | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
| Global.cc | -rw-r--r-- | 14.8 KB |
| Global.h | -rw-r--r-- | 15.5 KB |
| HIV_Epidemic.cc | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
| HIV_Epidemic.h | -rw-r--r-- | 672 bytes |
| HIV_Infection.cc | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
| HIV_Infection.h | -rw-r--r-- | 920 bytes |
| HIV_Natural_History.cc | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
| HIV_Natural_History.h | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
| Health.cc | -rw-r--r-- | 40.8 KB |
| Health.h | -rw-r--r-- | 23.3 KB |
| Hospital.cc | -rw-r--r-- | 15.2 KB |
| Hospital.h | -rw-r--r-- | 7.2 KB |
| Household.cc | -rw-r--r-- | 11.1 KB |
| Household.h | -rw-r--r-- | 16.1 KB |
| Infection.cc | -rw-r--r-- | 17.5 KB |
| Infection.h | -rw-r--r-- | 4.3 KB |
| Intention.cc | -rw-r--r-- | 5.0 KB |
| Intention.h | -rw-r--r-- | 1.8 KB |
| LOG1 | -rw-r--r-- | 0 bytes |
| MSEvolution.cc | -rw-r--r-- | 6.0 KB |
| MSEvolution.h | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
| Makefile | -rw-r--r-- | 6.4 KB |
| Manager.cc | -rw-r--r-- | 986 bytes |
| Manager.h | -rw-r--r-- | 2.3 KB |
| Markov_Epidemic.cc | -rw-r--r-- | 6.6 KB |
| Markov_Epidemic.h | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
| Markov_Infection.cc | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
| Markov_Infection.h | -rw-r--r-- | 1.0 KB |
| Markov_Model.cc | -rw-r--r-- | 4.1 KB |
| Markov_Model.h | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
| Markov_Natural_History.cc | -rw-r--r-- | 2.5 KB |
| Markov_Natural_History.h | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
| Mixing_Group.cc | -rw-r--r-- | 5.2 KB |
| Mixing_Group.h | -rw-r--r-- | 10.7 KB |
| Natural_History.cc | -rw-r--r-- | 16.8 KB |
| Natural_History.h | -rw-r--r-- | 5.8 KB |
| Neighborhood.cc | -rw-r--r-- | 3.8 KB |
| Neighborhood.h | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
| Neighborhood_Layer.cc | -rw-r--r-- | 27.6 KB |
| Neighborhood_Layer.h | -rw-r--r-- | 4.1 KB |
| Neighborhood_Patch.cc | -rw-r--r-- | 11.2 KB |
| Neighborhood_Patch.h | -rw-r--r-- | 4.9 KB |
| Network.cc | -rw-r--r-- | 8.5 KB |
| Network.h | -rw-r--r-- | 2.2 KB |
| ODE.cc | -rw-r--r-- | 13.4 KB |
| ODE.h | -rw-r--r-- | 6.8 KB |
| ODEIntraHost.cc | -rw-r--r-- | 3.2 KB |
| ODEIntraHost.h | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
| Office.cc | -rw-r--r-- | 2.8 KB |
| Office.h | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
| Params.cc | -rw-r--r-- | 14.5 KB |
| Params.h | -rw-r--r-- | 6.0 KB |
| Past_Infection.cc | -rw-r--r-- | 1.0 KB |
| Past_Infection.h | -rw-r--r-- | 975 bytes |
| Perceptions.cc | -rw-r--r-- | 2.9 KB |
| Perceptions.h | -rw-r--r-- | 1.8 KB |
| Person.cc | -rw-r--r-- | 7.6 KB |
| Person.h | -rw-r--r-- | 25.3 KB |
| Person_Network_Link.cc | -rw-r--r-- | 4.4 KB |
| Person_Network_Link.h | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
| Person_Place_Link.cc | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
| Person_Place_Link.h | -rw-r--r-- | 960 bytes |
| Piecewise_Linear.cc | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
| Piecewise_Linear.h | -rw-r--r-- | 962 bytes |
| Place.cc | -rw-r--r-- | 12.2 KB |
| Place.h | -rw-r--r-- | 11.3 KB |
| Place_List.cc | -rw-r--r-- | 106.9 KB |
| Place_List.h | -rw-r--r-- | 18.5 KB |
| Place_List_Quality_Control.cc | -rw-r--r-- | 28.3 KB |
| Policy.cc | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
| Policy.h | -rw-r--r-- | 2.0 KB |
| Population.cc | -rw-r--r-- | 71.2 KB |
| Population.h | -rw-r--r-- | 9.2 KB |
| README_Timestep_Maps | -rw-r--r-- | 4.0 KB |
| RSAIntraHost.cc | -rw-r--r-- | 7.4 KB |
| RSAIntraHost.h | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
| Random.cc | -rw-r--r-- | 4.3 KB |
| Random.h | -rw-r--r-- | 4.6 KB |
| Regional_Layer.cc | -rw-r--r-- | 9.0 KB |
| Regional_Layer.h | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
| Regional_Patch.cc | -rw-r--r-- | 9.1 KB |
| Regional_Patch.h | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
| Respiratory_Transmission.cc | -rw-r--r-- | 22.1 KB |
| Respiratory_Transmission.h | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
| School.cc | -rw-r--r-- | 16.0 KB |
| School.h | -rw-r--r-- | 5.4 KB |
| Seasonality.cc | -rw-r--r-- | 6.4 KB |
| Seasonality.h | -rw-r--r-- | 1.7 KB |
| Seasonality_Timestep_Map.cc | -rw-r--r-- | 5.6 KB |
| Seasonality_Timestep_Map.h | -rw-r--r-- | 5.4 KB |
| Sexual_Transmission.cc | -rw-r--r-- | 5.1 KB |
| Sexual_Transmission.h | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
| Sexual_Transmission_Network.cc | -rw-r--r-- | 1.8 KB |
| Sexual_Transmission_Network.h | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
| State.h | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
| Strain.cc | -rw-r--r-- | 1.8 KB |
| Strain.h | -rw-r--r-- | 2.4 KB |
| StrainTable.cc | -rw-r--r-- | 4.0 KB |
| StrainTable.h | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
| Timestep_Map.cc | -rw-r--r-- | 2.8 KB |
| Timestep_Map.h | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
| Tracker.h | -rw-r--r-- | 20.9 KB |
| Trajectory.cc | -rw-r--r-- | 8.6 KB |
| Trajectory.h | -rw-r--r-- | 2.9 KB |
| Transmission.cc | -rw-r--r-- | 2.2 KB |
| Transmission.h | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
| Travel.cc | -rw-r--r-- | 9.1 KB |
| Travel.h | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
| Utils.cc | -rw-r--r-- | 20.1 KB |
| Utils.h | -rw-r--r-- | 7.5 KB |
| Vaccine.cc | -rw-r--r-- | 2.0 KB |
| Vaccine.h | -rw-r--r-- | 2.7 KB |
| Vaccine_Dose.cc | -rw-r--r-- | 1.7 KB |
| Vaccine_Dose.h | -rw-r--r-- | 1.8 KB |
| Vaccine_Health.cc | -rw-r--r-- | 4.8 KB |
| Vaccine_Health.h | -rw-r--r-- | 2.5 KB |
| Vaccine_Manager.cc | -rw-r--r-- | 18.7 KB |
| Vaccine_Manager.h | -rw-r--r-- | 3.9 KB |
| Vaccine_Priority_Decisions.cc | -rw-r--r-- | 2.5 KB |
| Vaccine_Priority_Decisions.h | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
| Vaccine_Priority_Policies.cc | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
| Vaccine_Priority_Policies.h | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
| Vaccines.cc | -rw-r--r-- | 3.6 KB |
| Vaccines.h | -rw-r--r-- | 1021 bytes |
| Vector_Layer.cc | -rw-r--r-- | 45.1 KB |
| Vector_Layer.h | -rw-r--r-- | 4.3 KB |
| Vector_Patch.cc | -rw-r--r-- | 2.5 KB |
| Vector_Patch.h | -rw-r--r-- | 3.3 KB |
| Vector_Transmission.cc | -rw-r--r-- | 10.3 KB |
| Vector_Transmission.h | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
| Visualization_Layer.cc | -rw-r--r-- | 19.8 KB |
| Visualization_Layer.h | -rw-r--r-- | 2.5 KB |
| Visualization_Patch.cc | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
| Visualization_Patch.h | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
| Workplace.cc | -rw-r--r-- | 6.2 KB |
| Workplace.h | -rw-r--r-- | 4.2 KB |
| fsz.cc | -rw-r--r-- | 1.7 KB |
Computing file changes ...
