https://github.com/cran/ape
Revision a7a7774937a65c12a8995d3023196a0ee8f64832 authored by Emmanuel Paradis on 29 November 2015, 19:14:31 UTC, committed by Gabor Csardi on 29 November 2015, 19:14:31 UTC
1 parent 015cfe4
Tip revision: a7a7774937a65c12a8995d3023196a0ee8f64832 authored by Emmanuel Paradis on 29 November 2015, 19:14:31 UTC
version 3.4
version 3.4
Tip revision: a7a7774
File | Mode | Size |
---|---|---|
CADM.global.Rd | -rw-r--r-- | 8.8 KB |
DNAbin.Rd | -rw-r--r-- | 4.5 KB |
DNAbin2indel.Rd | -rw-r--r-- | 735 bytes |
Initialize.corPhyl.Rd | -rw-r--r-- | 956 bytes |
LTT.Rd | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
MPR.Rd | -rw-r--r-- | 2.3 KB |
MoranI.Rd | -rw-r--r-- | 2.8 KB |
SDM.Rd | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
ace.Rd | -rw-r--r-- | 11.6 KB |
add.scale.bar.Rd | -rw-r--r-- | 1.7 KB |
additive.Rd | -rw-r--r-- | 731 bytes |
alex.Rd | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
all.equal.phylo.Rd | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
alview.Rd | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
ape-internal.Rd | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
ape-package.Rd | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
as.alignment.Rd | -rw-r--r-- | 2.9 KB |
as.bitsplits.Rd | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
as.matching.Rd | -rw-r--r-- | 2.2 KB |
as.phylo.Rd | -rw-r--r-- | 3.4 KB |
as.phylo.formula.Rd | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
axisPhylo.Rd | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
balance.Rd | -rw-r--r-- | 1.0 KB |
base.freq.Rd | -rw-r--r-- | 2.0 KB |
bd.ext.Rd | -rw-r--r-- | 3.3 KB |
bd.time.Rd | -rw-r--r-- | 3.1 KB |
binaryPGLMM.Rd | -rw-r--r-- | 12.9 KB |
bind.tree.Rd | -rw-r--r-- | 4.0 KB |
bionj.Rd | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
bird.families.Rd | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
bird.orders.Rd | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
birthdeath.Rd | -rw-r--r-- | 2.7 KB |
boot.phylo.Rd | -rw-r--r-- | 6.5 KB |
branching.times.Rd | -rw-r--r-- | 875 bytes |
c.phylo.Rd | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
carnivora.Rd | -rw-r--r-- | 2.2 KB |
checkValidPhylo.Rd | -rw-r--r-- | 682 bytes |
cherry.Rd | -rw-r--r-- | 1.7 KB |
chiroptera.Rd | -rw-r--r-- | 764 bytes |
chronoMPL.Rd | -rw-r--r-- | 2.5 KB |
chronopl.Rd | -rw-r--r-- | 5.4 KB |
chronos.Rd | -rw-r--r-- | 5.2 KB |
clustal.Rd | -rw-r--r-- | 3.8 KB |
coalescent.intervals.Rd | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
collapse.singles.Rd | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
collapsed.intervals.Rd | -rw-r--r-- | 2.4 KB |
compar.cheverud.Rd | -rw-r--r-- | 2.5 KB |
compar.gee.Rd | -rw-r--r-- | 5.2 KB |
compar.lynch.Rd | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
compar.ou.Rd | -rw-r--r-- | 4.3 KB |
compute.brlen.Rd | -rw-r--r-- | 2.3 KB |
compute.brtime.Rd | -rw-r--r-- | 1.7 KB |
consensus.Rd | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
cophenetic.phylo.Rd | -rw-r--r-- | 937 bytes |
cophyloplot.Rd | -rw-r--r-- | 3.7 KB |
corBlomberg.Rd | -rw-r--r-- | 2.0 KB |
corBrownian.Rd | -rw-r--r-- | 2.2 KB |
corClasses.Rd | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
corGrafen.Rd | -rw-r--r-- | 2.2 KB |
corMartins.Rd | -rw-r--r-- | 2.2 KB |
corPagel.Rd | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
corphylo.Rd | -rw-r--r-- | 12.7 KB |
correlogram.formula.Rd | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
cynipids.Rd | -rw-r--r-- | 850 bytes |
dbd.Rd | -rw-r--r-- | 4.1 KB |
def.Rd | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
del.gaps.Rd | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
delta.plot.Rd | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
dist.dna.Rd | -rw-r--r-- | 9.9 KB |
dist.gene.Rd | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
dist.topo.Rd | -rw-r--r-- | 2.5 KB |
diversi.gof.Rd | -rw-r--r-- | 2.9 KB |
diversi.time.Rd | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
diversity.contrast.test.Rd | -rw-r--r-- | 4.1 KB |
drop.tip.Rd | -rw-r--r-- | 4.0 KB |
edges.Rd | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
evonet.Rd | -rw-r--r-- | 2.5 KB |
ewLasso.Rd | -rw-r--r-- | 2.0 KB |
fastme.Rd | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
gammaStat.Rd | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
hivtree.Rd | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
howmanytrees.Rd | -rw-r--r-- | 2.5 KB |
identify.phylo.Rd | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
image.DNAbin.Rd | -rw-r--r-- | 2.7 KB |
is.binary.tree.Rd | -rw-r--r-- | 1.0 KB |
is.compatible.Rd | -rw-r--r-- | 738 bytes |
is.monophyletic.Rd | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
is.ultrametric.Rd | -rw-r--r-- | 815 bytes |
kronoviz.Rd | -rw-r--r-- | 946 bytes |
label2table.Rd | -rw-r--r-- | 2.0 KB |
ladderize.Rd | -rw-r--r-- | 767 bytes |
landplants.Rd | -rw-r--r-- | 914 bytes |
lmorigin.Rd | -rw-r--r-- | 5.1 KB |
ltt.plot.Rd | -rw-r--r-- | 6.8 KB |
makeLabel.Rd | -rw-r--r-- | 2.7 KB |
makeNodeLabel.Rd | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
mantel.test.Rd | -rw-r--r-- | 2.7 KB |
mat3.Rd | -rw-r--r-- | 587 bytes |
mat5M3ID.Rd | -rw-r--r-- | 332 bytes |
mat5Mrand.Rd | -rw-r--r-- | 328 bytes |
matexpo.Rd | -rw-r--r-- | 525 bytes |
mcconwaysims.test.Rd | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
mcmc.popsize.Rd | -rw-r--r-- | 5.8 KB |
mixedFontLabel.Rd | -rw-r--r-- | 2.3 KB |
mrca.Rd | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
mst.Rd | -rw-r--r-- | 2.9 KB |
multi2di.Rd | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
multiphylo.Rd | -rw-r--r-- | 2.0 KB |
mvr.Rd | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
nj.Rd | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
njs.Rd | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
node.depth.Rd | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
nodelabels.Rd | -rw-r--r-- | 7.1 KB |
nodepath.Rd | -rw-r--r-- | 791 bytes |
opsin.Rd | -rw-r--r-- | 847 bytes |
parafit.Rd | -rw-r--r-- | 7.4 KB |
pcoa.Rd | -rw-r--r-- | 7.0 KB |
phydataplot.Rd | -rw-r--r-- | 6.0 KB |
phymltest.Rd | -rw-r--r-- | 6.1 KB |
pic.Rd | -rw-r--r-- | 2.7 KB |
pic.ortho.Rd | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
plot.correlogram.Rd | -rw-r--r-- | 2.2 KB |
plot.phylo.Rd | -rw-r--r-- | 12.0 KB |
plot.varcomp.Rd | -rw-r--r-- | 655 bytes |
print.phylo.Rd | -rw-r--r-- | 1.0 KB |
rTraitCont.Rd | -rw-r--r-- | 3.8 KB |
rTraitDisc.Rd | -rw-r--r-- | 3.9 KB |
rTraitMult.Rd | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
read.GenBank.Rd | -rw-r--r-- | 2.5 KB |
read.caic.Rd | -rw-r--r-- | 1.7 KB |
read.dna.Rd | -rw-r--r-- | 6.2 KB |
read.nexus.Rd | -rw-r--r-- | 2.2 KB |
read.nexus.data.Rd | -rw-r--r-- | 3.7 KB |
read.tree.Rd | -rw-r--r-- | 5.0 KB |
reconstruct.Rd | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
reorder.phylo.Rd | -rw-r--r-- | 2.4 KB |
richness.yule.test.Rd | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
rlineage.Rd | -rw-r--r-- | 4.3 KB |
root.Rd | -rw-r--r-- | 3.4 KB |
rotate.Rd | -rw-r--r-- | 3.5 KB |
rtree.Rd | -rw-r--r-- | 2.4 KB |
rtt.Rd | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
seg.sites.Rd | -rw-r--r-- | 731 bytes |
skyline.Rd | -rw-r--r-- | 5.2 KB |
skylineplot.Rd | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
slowinskiguyer.test.Rd | -rw-r--r-- | 2.4 KB |
speciesTree.Rd | -rw-r--r-- | 2.0 KB |
stree.Rd | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
subtreeplot.Rd | -rw-r--r-- | 1.8 KB |
subtrees.Rd | -rw-r--r-- | 1.0 KB |
summary.phylo.Rd | -rw-r--r-- | 1.7 KB |
treePop.Rd | -rw-r--r-- | 425 bytes |
trex.Rd | -rw-r--r-- | 2.5 KB |
triangMtd.Rd | -rw-r--r-- | 769 bytes |
unique.multiPhylo.Rd | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
varCompPhylip.Rd | -rw-r--r-- | 2.7 KB |
varcomp.Rd | -rw-r--r-- | 977 bytes |
vcv.phylo.Rd | -rw-r--r-- | 1.8 KB |
vcv2phylo.Rd | -rw-r--r-- | 843 bytes |
weight.taxo.Rd | -rw-r--r-- | 816 bytes |
where.Rd | -rw-r--r-- | 913 bytes |
which.edge.Rd | -rw-r--r-- | 875 bytes |
woodmouse.Rd | -rw-r--r-- | 861 bytes |
write.dna.Rd | -rw-r--r-- | 3.7 KB |
write.nexus.Rd | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
write.nexus.data.Rd | -rw-r--r-- | 2.8 KB |
write.tree.Rd | -rw-r--r-- | 2.2 KB |
yule.Rd | -rw-r--r-- | 1.7 KB |
yule.cov.Rd | -rw-r--r-- | 4.0 KB |
yule.time.Rd | -rw-r--r-- | 3.2 KB |
zoom.Rd | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
![swh spinner](/static/img/swh-spinner.gif)
Computing file changes ...