swh:1:snp:db729908d1cfe485303084fad7619a9d74607423
History
Tip revision: b24d8121509cdfc745d73dd3b90da5571a6d4db9 authored by Rob Davies on 18 July 2018, 08:33:37 UTC
Release 1.9
Tip revision: b24d812
File Mode Size
.github
.travis
examples
lz4
m4
misc
test
win32
.appveyor.yml -rw-r--r-- 1.9 KB
.gitattributes -rw-r--r-- 454 bytes
.gitignore -rw-r--r-- 304 bytes
.travis.yml -rw-r--r-- 1.2 KB
AUTHORS -rw-r--r-- 828 bytes
ChangeLog.old -rw-r--r-- 113.6 KB
INSTALL -rw-r--r-- 8.9 KB
LICENSE -rw-r--r-- 1.7 KB
Makefile -rw-r--r-- 15.4 KB
Makefile.mingw -rw-r--r-- 2.0 KB
NEWS -rw-r--r-- 46.3 KB
README -rw-r--r-- 3.9 KB
README.md -rw-r--r-- 1.2 KB
bam.c -rw-r--r-- 8.6 KB
bam.h -rw-r--r-- 20.5 KB
bam2bcf.c -rw-r--r-- 30.8 KB
bam2bcf.h -rw-r--r-- 5.0 KB
bam2bcf_indel.c -rw-r--r-- 23.7 KB
bam2depth.c -rw-r--r-- 13.0 KB
bam_addrprg.c -rw-r--r-- 14.6 KB
bam_aux.c -rw-r--r-- 2.7 KB
bam_cat.c -rw-r--r-- 19.2 KB
bam_color.c -rw-r--r-- 4.8 KB
bam_endian.h -rw-r--r-- 2.2 KB
bam_flags.c -rw-r--r-- 3.1 KB
bam_import.c -rw-r--r-- 2.3 KB
bam_index.c -rw-r--r-- 7.3 KB
bam_lpileup.c -rw-r--r-- 6.8 KB
bam_lpileup.h -rw-r--r-- 2.0 KB
bam_markdup.c -rw-r--r-- 32.3 KB
bam_mate.c -rw-r--r-- 17.3 KB
bam_md.c -rw-r--r-- 11.5 KB
bam_plbuf.c -rw-r--r-- 2.1 KB
bam_plbuf.h -rw-r--r-- 1.8 KB
bam_plcmd.c -rw-r--r-- 47.5 KB
bam_quickcheck.c -rw-r--r-- 6.4 KB
bam_reheader.c -rw-r--r-- 15.7 KB
bam_rmdup.c -rw-r--r-- 10.3 KB
bam_rmdupse.c -rw-r--r-- 7.1 KB
bam_sort.c -rw-r--r-- 82.8 KB
bam_split.c -rw-r--r-- 20.9 KB
bam_stat.c -rw-r--r-- 7.2 KB
bam_tview.c -rw-r--r-- 16.1 KB
bam_tview.h -rw-r--r-- 3.3 KB
bam_tview_curses.c -rw-r--r-- 11.5 KB
bam_tview_html.c -rw-r--r-- 10.6 KB
bamshuf.c -rw-r--r-- 18.6 KB
bamtk.c -rw-r--r-- 9.2 KB
bedcov.c -rw-r--r-- 6.7 KB
bedidx.c -rw-r--r-- 18.2 KB
bedidx.h -rw-r--r-- 1.7 KB
config.mk.in -rw-r--r-- 2.1 KB
configure.ac -rw-r--r-- 5.2 KB
cut_target.c -rw-r--r-- 8.4 KB
dict.c -rw-r--r-- 5.1 KB
faidx.c -rw-r--r-- 13.3 KB
install-sh -rwxr-xr-x 14.3 KB
padding.c -rw-r--r-- 25.9 KB
phase.c -rw-r--r-- 27.7 KB
sam.c -rw-r--r-- 4.8 KB
sam.h -rw-r--r-- 5.2 KB
sam_header.c -rw-r--r-- 22.1 KB
sam_header.h -rw-r--r-- 2.7 KB
sam_opts.c -rw-r--r-- 5.9 KB
sam_opts.h -rw-r--r-- 3.9 KB
sam_utils.c -rw-r--r-- 2.1 KB
sam_view.c -rw-r--r-- 58.1 KB
sample.c -rw-r--r-- 4.4 KB
sample.h -rw-r--r-- 1.5 KB
samtools.1 -rw-r--r-- 71.1 KB
samtools.h -rw-r--r-- 1.5 KB
stats.c -rw-r--r-- 89.4 KB
stats_isize.c -rw-r--r-- 7.4 KB
stats_isize.h -rw-r--r-- 2.4 KB
tmp_file.c -rw-r--r-- 15.2 KB
tmp_file.h -rw-r--r-- 4.4 KB
version.sh -rwxr-xr-x 316 bytes

README.md

back to top