https://github.com/grenaud/libbam
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Tip revision: c210c1ce1d4f0e1fe07fcbb4a438f9a7a2e3cf9b authored by grenaud on 24 June 2022, 09:00:06 UTC
subsample
Tip revision: c210c1c
File Mode Size
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README -rw-r--r-- 95 bytes
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addRG.cpp -rw-r--r-- 2.1 KB
addRGInReadAndHeader.cpp -rw-r--r-- 1.9 KB
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addRGinHeaderHack.cpp -rw-r--r-- 2.9 KB
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allPassqc.cpp -rw-r--r-- 1.4 KB
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cutEndKeepBeginning.cpp -rw-r--r-- 3.4 KB
cutReadsDistribution.cpp -rw-r--r-- 3.2 KB
cutStart.cpp -rw-r--r-- 3.0 KB
cutUMI.cpp -rw-r--r-- 1.7 KB
decrQualDeaminated.cpp -rw-r--r-- 6.9 KB
decrQualDeaminatedDoubleStranded.cpp -rw-r--r-- 4.0 KB
decrQualNs.cpp -rw-r--r-- 3.5 KB
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filterDeaminatedpreload1000g.cpp -rw-r--r-- 13.5 KB
filterEditDist.cpp -rw-r--r-- 2.1 KB
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fixMates.cpp -rw-r--r-- 2.4 KB
insertSize.cpp -rw-r--r-- 1.6 KB
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removeIndices.cpp -rw-r--r-- 2.3 KB
removeRG.cpp -rw-r--r-- 1.3 KB
removeTagsMapping.cpp -rw-r--r-- 4.0 KB
removeThoseWithoutMD.cpp -rw-r--r-- 1.3 KB
removeUnalignedANDWrongCigar.cpp -rw-r--r-- 2.5 KB
replaceRG.cpp -rw-r--r-- 1.5 KB
retrieveMappedCertainIsize.cpp -rw-r--r-- 3.0 KB
retrieveMapped_single_and_ProperlyPair.cpp -rw-r--r-- 2.0 KB
retrieveMapped_single_and_ProperlyPair_NoPCR.cpp -rw-r--r-- 2.5 KB
retrieveRG.cpp -rw-r--r-- 1.8 KB
retrieveReadsWithName.cpp -rw-r--r-- 2.8 KB
setAsUnpaired.cpp -rw-r--r-- 2.0 KB
singleAndFirstMate.cpp -rw-r--r-- 1.3 KB
splitByChr.cpp -rw-r--r-- 3.0 KB
splitByRG.cpp -rw-r--r-- 4.3 KB
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subsamplebamFixedNumberCollate.cpp -rw-r--r-- 4.4 KB
subsamplebamFixedNumberPair.cpp -rw-r--r-- 3.0 KB
subsamplebamFixedNumberSingleFirstMate.cpp -rw-r--r-- 3.2 KB
sumBases.cpp -rw-r--r-- 1.1 KB
tallyByRG.cpp -rw-r--r-- 3.1 KB
transBAM.cpp -rw-r--r-- 6.5 KB
transBAMperRead.cpp -rw-r--r-- 5.4 KB

README

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