https://github.com/sarah-ku/targets_arabidopsis
Tip revision: ab778b60f735a07d2ef181edc5b2dfbf25153021 authored by Sarah Rennie on 15 April 2021, 18:58:12 UTC
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Tip revision: ab778b6
| File | Mode | Size |
|---|---|---|
| .gitignore | -rw-r--r-- | 40 bytes |
| ECT2_hyperTRIBE_model_data.R | -rw-r--r-- | 3.5 KB |
| ECT3_hyperTRIBE_model_data.R | -rw-r--r-- | 6.1 KB |
| annotate_anderson.R | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
| annotate_m6A_data.R | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
| denyer_analysis_targets.R | -rw-r--r-- | 3.5 KB |
| hyperTRIBE_mapping_stats.R | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
| hyperTRIBE_pos_lists.R | -rw-r--r-- | 990 bytes |
| hyperTRIBE_run_bash_commands.sh | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
| iCLIP_annotate_binding_sites.R | -rw-r--r-- | 2.7 KB |
| make_gene_lists_with_tables.R | -rw-r--r-- | 25.4 KB |
| motifs_RF.R | -rw-r--r-- | 6.4 KB |
| motifs_all_5mers.R | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
| motifs_binding_sites.R | -rw-r--r-- | 63.8 KB |
| motifs_fimo_generate_clean.R | -rw-r--r-- | 24.4 KB |
| motifs_functions.R | -rw-r--r-- | 19.0 KB |
| motifs_investigation.R | -rw-r--r-- | 46.3 KB |
| sequence_at_peaks_proportions.R | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
| targets_arabidopsis.Rproj | -rw-r--r-- | 205 bytes |
| targets_make_gene_lists.R | -rw-r--r-- | 19.1 KB |
| targets_paper_fig2.R | -rw-r--r-- | 37.6 KB |
| targets_paper_fig4.R | -rw-r--r-- | 19.7 KB |
| targets_paper_open.R | -rw-r--r-- | 3.9 KB |
