File | Mode | Size |
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AddAzimuthScores.Rd | -rw-r--r-- | 594 bytes |
AddModuleScore.Rd | -rw-r--r-- | 2.5 KB |
AggregateExpression.Rd | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
AnchorSet-class.Rd | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
AnnotateAnchors.Rd | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
Assay-class.Rd | -rw-r--r-- | 407 bytes |
AugmentPlot.Rd | -rw-r--r-- | 846 bytes |
AutoPointSize.Rd | -rw-r--r-- | 597 bytes |
AverageExpression.Rd | -rw-r--r-- | 2.4 KB |
BGTextColor.Rd | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
BarcodeInflectionsPlot.Rd | -rw-r--r-- | 1.0 KB |
BridgeCellsRepresentation.Rd | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
BridgeReferenceSet-class.Rd | -rw-r--r-- | 734 bytes |
BuildClusterTree.Rd | -rw-r--r-- | 2.0 KB |
BuildNicheAssay.Rd | -rw-r--r-- | 908 bytes |
CCAIntegration.Rd | -rw-r--r-- | 3.9 KB |
CalcDispersion.Rd | -rw-r--r-- | 752 bytes |
CalcPerturbSig.Rd | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
CalculateBarcodeInflections.Rd | -rw-r--r-- | 2.4 KB |
CaseMatch.Rd | -rw-r--r-- | 602 bytes |
CellCycleScoring.Rd | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
CellScatter.Rd | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
CellSelector.Rd | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
Cells.Rd | -rw-r--r-- | 582 bytes |
CellsByImage.Rd | -rw-r--r-- | 645 bytes |
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CollapseSpeciesExpressionMatrix.Rd | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
ColorDimSplit.Rd | -rw-r--r-- | 4.4 KB |
CombinePlots.Rd | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
CountSketch.Rd | -rw-r--r-- | 765 bytes |
CreateCategoryMatrix.Rd | -rw-r--r-- | 539 bytes |
CreateSCTAssayObject.Rd | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
CustomDistance.Rd | -rw-r--r-- | 825 bytes |
CustomPalette.Rd | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
DEenrichRPlot.Rd | -rw-r--r-- | 4.4 KB |
DISP.Rd | -rw-r--r-- | 458 bytes |
DietSeurat.Rd | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
DimHeatmap.Rd | -rw-r--r-- | 2.4 KB |
DimPlot.Rd | -rw-r--r-- | 4.8 KB |
DimReduc-class.Rd | -rw-r--r-- | 454 bytes |
DiscretePalette.Rd | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
DoHeatmap.Rd | -rw-r--r-- | 2.5 KB |
DotPlot.Rd | -rw-r--r-- | 2.7 KB |
ElbowPlot.Rd | -rw-r--r-- | 800 bytes |
ExpMean.Rd | -rw-r--r-- | 466 bytes |
ExpSD.Rd | -rw-r--r-- | 439 bytes |
ExpVar.Rd | -rw-r--r-- | 429 bytes |
FastRPCAIntegration.Rd | -rw-r--r-- | 2.4 KB |
FastRowScale.Rd | -rw-r--r-- | 704 bytes |
FeaturePlot.Rd | -rw-r--r-- | 5.6 KB |
FeatureScatter.Rd | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
FetchResidualSCTModel.Rd | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
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FilterSlideSeq.Rd | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
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FindMarkers.Rd | -rw-r--r-- | 11.9 KB |
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FindTransferAnchors.Rd | -rw-r--r-- | 8.1 KB |
FindVariableFeatures.Rd | -rw-r--r-- | 4.7 KB |
FoldChange.Rd | -rw-r--r-- | 3.4 KB |
GaussianSketch.Rd | -rw-r--r-- | 534 bytes |
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GetResidual.Rd | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
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Graph-class.Rd | -rw-r--r-- | 354 bytes |
GroupCorrelation.Rd | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
GroupCorrelationPlot.Rd | -rw-r--r-- | 850 bytes |
HTODemux.Rd | -rw-r--r-- | 2.0 KB |
HTOHeatmap.Rd | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
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HarmonyIntegration.Rd | -rw-r--r-- | 2.9 KB |
HoverLocator.Rd | -rw-r--r-- | 956 bytes |
IFeaturePlot.Rd | -rw-r--r-- | 805 bytes |
ISpatialDimPlot.Rd | -rw-r--r-- | 771 bytes |
ISpatialFeaturePlot.Rd | -rw-r--r-- | 872 bytes |
ImageDimPlot.Rd | -rw-r--r-- | 3.3 KB |
ImageFeaturePlot.Rd | -rw-r--r-- | 4.4 KB |
IntegrateData.Rd | -rw-r--r-- | 5.9 KB |
IntegrateEmbeddings.Rd | -rw-r--r-- | 4.2 KB |
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IntegrationAnchorSet-class.Rd | -rw-r--r-- | 406 bytes |
IntegrationData-class.Rd | -rw-r--r-- | 941 bytes |
JackStraw.Rd | -rw-r--r-- | 1.7 KB |
JackStrawData-class.Rd | -rw-r--r-- | 402 bytes |
JackStrawPlot.Rd | -rw-r--r-- | 1.7 KB |
JointPCAIntegration.Rd | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
L2CCA.Rd | -rw-r--r-- | 353 bytes |
L2Dim.Rd | -rw-r--r-- | 609 bytes |
LabelClusters.Rd | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
LabelPoints.Rd | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
LeverageScore.Rd | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
LinkedPlots.Rd | -rw-r--r-- | 1.8 KB |
Load10X_Spatial.Rd | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
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LocalStruct.Rd | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
LogNormalize.Rd | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
LogVMR.Rd | -rw-r--r-- | 489 bytes |
MULTIseqDemux.Rd | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
MVP.Rd | -rw-r--r-- | 714 bytes |
MapQuery.Rd | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
MappingScore.Rd | -rw-r--r-- | 2.8 KB |
MetaFeature.Rd | -rw-r--r-- | 1008 bytes |
MinMax.Rd | -rw-r--r-- | 690 bytes |
MixingMetric.Rd | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
MixscapeHeatmap.Rd | -rw-r--r-- | 5.1 KB |
MixscapeLDA.Rd | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
ModalityWeights-class.Rd | -rw-r--r-- | 1012 bytes |
NNPlot.Rd | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
NNtoGraph.Rd | -rw-r--r-- | 564 bytes |
Neighbor-class.Rd | -rw-r--r-- | 372 bytes |
NormalizeData.Rd | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
PCASigGenes.Rd | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
PercentAbove.Rd | -rw-r--r-- | 574 bytes |
PercentageFeatureSet.Rd | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
PlotClusterTree.Rd | -rw-r--r-- | 908 bytes |
PlotPerturbScore.Rd | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
PolyDimPlot.Rd | -rw-r--r-- | 846 bytes |
PolyFeaturePlot.Rd | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
PredictAssay.Rd | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
PrepLDA.Rd | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
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PrepareBridgeReference.Rd | -rw-r--r-- | 3.1 KB |
ProjectCellEmbeddings.Rd | -rw-r--r-- | 2.9 KB |
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ProjectUMAP.Rd | -rw-r--r-- | 3.1 KB |
PseudobulkExpression.Rd | -rw-r--r-- | 417 bytes |
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Radius.Rd | -rw-r--r-- | 500 bytes |
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ReadAkoya.Rd | -rw-r--r-- | 2.8 KB |
ReadMtx.Rd | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
ReadNanostring.Rd | -rw-r--r-- | 4.7 KB |
ReadParseBio.Rd | -rw-r--r-- | 416 bytes |
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ReadVizgen.Rd | -rw-r--r-- | 5.0 KB |
ReadXenium.Rd | -rw-r--r-- | 1.8 KB |
RegroupIdents.Rd | -rw-r--r-- | 603 bytes |
RelativeCounts.Rd | -rw-r--r-- | 794 bytes |
RenameCells.Rd | -rw-r--r-- | 793 bytes |
RidgePlot.Rd | -rw-r--r-- | 2.0 KB |
RunCCA.Rd | -rw-r--r-- | 2.5 KB |
RunGraphLaplacian.Rd | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
RunICA.Rd | -rw-r--r-- | 2.2 KB |
RunLDA.Rd | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
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RunMixscape.Rd | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
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SampleUMI.Rd | -rw-r--r-- | 813 bytes |
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Seurat-class.Rd | -rw-r--r-- | 436 bytes |
Seurat-package.Rd | -rw-r--r-- | 4.5 KB |
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SeuratTheme.Rd | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
SingleCorPlot.Rd | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
SingleDimPlot.Rd | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
SingleExIPlot.Rd | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
SingleImageMap.Rd | -rw-r--r-- | 605 bytes |
SingleImagePlot.Rd | -rw-r--r-- | 2.9 KB |
SingleRasterMap.Rd | -rw-r--r-- | 1.0 KB |
SingleSpatialPlot.Rd | -rw-r--r-- | 2.0 KB |
SketchData.Rd | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
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SpatialImage-class.Rd | -rw-r--r-- | 396 bytes |
SpatialPlot.Rd | -rw-r--r-- | 5.8 KB |
SplitObject.Rd | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
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VST.Rd | -rw-r--r-- | 1.7 KB |
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VlnPlot.Rd | -rw-r--r-- | 2.7 KB |
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subset.AnchorSet.Rd | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
writing-integration.Rd | -rw-r--r-- | 1.8 KB |