https://github.com/PerezOrtegaJ/Neural_Ensemble_Analysis
History
Tip revision: 9d37fd031dfbdb4eb69faa449d0a6416267a7d4f authored by Jesús Pérez on 28 July 2020, 20:36:58 UTC
Update README.md
Tip revision: 9d37fd0
File Mode Size
common
.DS_Store -rw-r--r-- 6.0 KB
Bin_Signal.m -rw-r--r-- 1.1 KB
CCidx2_JP.m -rw-r--r-- 1.0 KB
Change_Names_MEA_Channels.m -rw-r--r-- 325 bytes
Change_Sequence_Numbers.m -rw-r--r-- 609 bytes
Circle_Mask.m -rw-r--r-- 300 bytes
ClustIdx_JP.m -rw-r--r-- 1.7 KB
Cluster_Test.m -rw-r--r-- 2.9 KB
Compare_Ensembles.m -rw-r--r-- 1.4 KB
Compare_Times.m -rw-r--r-- 2.7 KB
ContrastIdx_JP.m -rw-r--r-- 806 bytes
DaviesIdx_JP.m -rw-r--r-- 1.2 KB
Delete_Consecutive_Coactivation.m -rw-r--r-- 434 bytes
Delete_Raster_Activity_Between_Trials.m -rw-r--r-- 378 bytes
Divide_Peaks.m -rw-r--r-- 673 bytes
DunnIdx_JP.m -rw-r--r-- 709 bytes
Ensemble_Correlation.m -rw-r--r-- 785 bytes
Extract_Raster_Peaks.m -rw-r--r-- 672 bytes
Filter_MEA_Channel.m -rw-r--r-- 541 bytes
Find_Peaks_Or_Valleys.m -rw-r--r-- 7.7 KB
Find_Threshold_In_Cumulative_Distribution.m -rw-r--r-- 528 bytes
Fit_Power_Law.m -rw-r--r-- 383 bytes
Get_Adjacency_From_Raster.m -rw-r--r-- 1.1 KB
Get_Adjacency_From_Sequence.m -rw-r--r-- 459 bytes
Get_And_Filter_Coactivity.m -rw-r--r-- 426 bytes
Get_Circular_XY.m -rw-r--r-- 552 bytes
Get_Colors_From_Structure.m -rw-r--r-- 969 bytes
Get_Consecutive_Vector_Indices.m -rw-r--r-- 432 bytes
Get_Efficiency.m -rw-r--r-- 627 bytes
Get_Ensemble_Identity.m -rw-r--r-- 779 bytes
Get_Ensemble_Networks.m -rw-r--r-- 813 bytes
Get_Ensemble_Similarity.m -rw-r--r-- 822 bytes
Get_Ensembles.m -rw-r--r-- 4.1 KB
Get_Ensembles_Length.m -rw-r--r-- 704 bytes
Get_Entropy.m -rw-r--r-- 355 bytes
Get_Force_XY.m -rw-r--r-- 539 bytes
Get_Groups_Of_Neurons.m -rw-r--r-- 1.5 KB
Get_ISI.m -rw-r--r-- 269 bytes
Get_Identity_Changes.m -rw-r--r-- 920 bytes
Get_Indices_Before_And_After_Stimulus.m -rw-r--r-- 445 bytes
Get_Instant_Freq.m -rw-r--r-- 815 bytes
Get_Network_Activation_Sequence.m -rw-r--r-- 2.4 KB
Get_Normalized_Instant_Freq.m -rw-r--r-- 1.0 KB
Get_Orientation_Index.m -rw-r--r-- 1.6 KB
Get_Peak_Or_Valley_Indices.m -rw-r--r-- 316 bytes
Get_Peak_Vectors.m -rw-r--r-- 5.5 KB
Get_Peaks_Sequence_Sorted.m -rw-r--r-- 588 bytes
Get_Peaks_Similarity.m -rw-r--r-- 778 bytes
Get_Peaks_Similarity_OLD.m -rw-r--r-- 3.1 KB
Get_Raster_From_MEA.m -rw-r--r-- 1.1 KB
Get_Raster_From_MEA_Channels.m -rw-r--r-- 1.1 KB
Get_Raster_From_Time_Stamps.m -rw-r--r-- 1.3 KB
Get_Relevant_Coactivations.m -rw-r--r-- 2.2 KB
Get_Significant_Network_From_Raster.m -rw-r--r-- 2.3 KB
Get_Significant_Network_From_Raster_And_Correlation.m -rw-r--r-- 2.8 KB
Get_SmallWorld_Properties.m -rw-r--r-- 1.9 KB
Get_Spike_Rate.m -rw-r--r-- 426 bytes
Get_Spikes_Shape_From_MEA_Channels.m -rw-r--r-- 1.6 KB
Get_XY_Ensembles.m -rw-r--r-- 1.7 KB
Get_Zscore_From_Raster.m -rw-r--r-- 508 bytes
Hold_Axes.m -rw-r--r-- 163 bytes
Hold_Figure.m -rw-r--r-- 134 bytes
Hotelling_T2_Test.m -rw-r--r-- 4.6 KB
Jitter_Raster.m -rw-r--r-- 913 bytes
Join_Peaks.m -rw-r--r-- 457 bytes
LICENSE -rw-r--r-- 34.3 KB
Make_Regular_Ring_Network.m -rw-r--r-- 1.3 KB
Mix_Structure.m -rw-r--r-- 730 bytes
Network_Resilience.m -rw-r--r-- 1.2 KB
Neural_Ensemble_Analysis.fig -rw-r--r-- 2.7 MB
Neural_Ensemble_Analysis.m -rw-r--r-- 106.8 KB
PeaksVectors_JP_OLD.m -rw-r--r-- 791 bytes
Plot_Activation_Order.m -rw-r--r-- 2.4 KB
Plot_Adjacencies_And_Network.m -rw-r--r-- 1.5 KB
Plot_Adjacency.m -rw-r--r-- 310 bytes
Plot_Changes_In_Neurons.m -rw-r--r-- 634 bytes
Plot_Coactivity.m -rw-r--r-- 1.1 KB
Plot_Degree_Distribution.m -rw-r--r-- 2.0 KB
Plot_Edge.m -rw-r--r-- 2.2 KB
Plot_Ensemble_Structure.m -rw-r--r-- 1.4 KB
Plot_Ensembles.m -rw-r--r-- 1.2 KB
Plot_Ensembles_Duration_Histogram.m -rw-r--r-- 1.2 KB
Plot_Ensembles_Length.m -rw-r--r-- 1.4 KB
Plot_Hierarchy.m -rw-r--r-- 1.6 KB
Plot_Location_Ensembles_A_And_B.m -rw-r--r-- 1.3 KB
Plot_Network.m -rw-r--r-- 3.5 KB
Plot_Network_Edges.m -rw-r--r-- 2.0 KB
Plot_Peaks_On_Coactivity.m -rw-r--r-- 1.5 KB
Plot_Peaks_On_Raster.m -rw-r--r-- 1.0 KB
Plot_Raster.m -rw-r--r-- 1.4 KB
Plot_Raster_And_Similarity.m -rw-r--r-- 1.7 KB
Plot_Raster_By_Stimulus.m -rw-r--r-- 639 bytes
Plot_Raster_Ensembles.m -rw-r--r-- 1.4 KB
Plot_Raster_Ensembles_A_VS_B.m -rw-r--r-- 1.5 KB
Plot_Raster_Esembles_Through_Days.m -rw-r--r-- 1.5 KB
Plot_Raster_Limit.m -rw-r--r-- 1.2 KB
Plot_Raster_Motion_Stimulus.m -rw-r--r-- 1.3 KB
Plot_Rich_Club.m -rw-r--r-- 1.3 KB
Plot_Sequence_Graph_By_Width.m -rw-r--r-- 1.5 KB
Plot_Sequences.m -rw-r--r-- 1.7 KB
Plot_Similarity.m -rw-r--r-- 1.2 KB
Plot_Similarity_With_Dendrogram.m -rw-r--r-- 1.2 KB
Plot_Small_World.m -rw-r--r-- 838 bytes
Plot_Spikes.m -rw-r--r-- 922 bytes
Plot_Spikes_From_ISI.m -rw-r--r-- 495 bytes
Plot_States_By_Width.m -rw-r--r-- 1.4 KB
Plot_States_Sequence.m -rw-r--r-- 1.7 KB
Plot_WD_Network.m -rw-r--r-- 1.9 KB
Plot_WU_Network.m -rw-r--r-- 2.5 KB
README.md -rw-r--r-- 618 bytes
RV_coefficient.m -rw-r--r-- 292 bytes
Read_Colors.m -rw-r--r-- 1.7 KB
Remove_Noisy_Spikes.m -rw-r--r-- 928 bytes
Remove_Oscillations.m -rw-r--r-- 414 bytes
Reshape_Raster.m -rw-r--r-- 457 bytes
Save_Figure.m -rw-r--r-- 1.1 KB
Save_Raster_By_Windows.m -rw-r--r-- 685 bytes
Save_Raster_Min_By_Min.m -rw-r--r-- 556 bytes
Scale.m -rw-r--r-- 646 bytes
Set_Axes.m -rw-r--r-- 176 bytes
Set_Colormap_Blue_White_Red.m -rw-r--r-- 306 bytes
Set_Figure.m -rw-r--r-- 510 bytes
Set_Label_Time.m -rw-r--r-- 867 bytes
Shuffle_Test.m -rw-r--r-- 3.3 KB
Shuffle_Test_For_Every_Link.m -rw-r--r-- 1.4 KB
Shuffle_Test_For_Weighted_Matrix.m -rw-r--r-- 2.2 KB
Similarity_Between_Rasters.m -rw-r--r-- 762 bytes
Similarity_Within_Rasters.m -rw-r--r-- 498 bytes
Sort_Activation_Position.m -rw-r--r-- 1.6 KB
Sort_Raster.m -rw-r--r-- 512 bytes
Sort_Raster_By_Distance.m -rw-r--r-- 695 bytes
Z_Score_Coactivity.m -rw-r--r-- 1.8 KB
betweenness_bin.m -rw-r--r-- 1.8 KB
charpath.m -rw-r--r-- 3.1 KB
clustering_coef_bu.m -rw-r--r-- 707 bytes
degrees_und.m -rw-r--r-- 435 bytes
density_und.m -rw-r--r-- 726 bytes
dist_corr.m -rw-r--r-- 120 bytes
distance_bin.m -rw-r--r-- 1.3 KB
distcorr.m -rw-r--r-- 1.2 KB
efficiency_bin.m -rw-r--r-- 2.7 KB
eigenvector_centrality_und.m -rw-r--r-- 1.2 KB
get_components.m -rw-r--r-- 1.7 KB
kcore_bu.m -rw-r--r-- 1.7 KB
kcoreness_centrality_bu.m -rw-r--r-- 1.1 KB
makerandCIJ_und.m -rw-r--r-- 594 bytes
modularity_und.m -rw-r--r-- 5.2 KB
pagerank_centrality.m -rw-r--r-- 2.0 KB
rich_club_bu.m -rw-r--r-- 2.0 KB
shuffle.m -rw-r--r-- 3.5 KB

README.md

back to top