| File | Mode | Size |
|---|---|---|
| include | ||
| Pileup.py | -rw-r--r-- | 8.1 KB |
| VCF.py.obsolete | -rw-r--r-- | 46.5 KB |
| __init__.py | -rw-r--r-- | 3.1 KB |
| alternatives.py.obsolete | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
| bcftools.py | -rw-r--r-- | 428 bytes |
| calignedsegment.pxd | -rw-r--r-- | 2.9 KB |
| calignedsegment.pyx | -rw-r--r-- | 80.0 KB |
| calignmentfile.pxd | -rw-r--r-- | 3.9 KB |
| calignmentfile.pyx | -rw-r--r-- | 83.5 KB |
| cbcf.pxd | -rw-r--r-- | 4.9 KB |
| cbcf.pyx | -rw-r--r-- | 117.9 KB |
| cfaidx.pxd | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
| cfaidx.pyx | -rw-r--r-- | 17.0 KB |
| chtslib.pxd | -rw-r--r-- | 78.4 KB |
| chtslib.pyx | -rw-r--r-- | 455 bytes |
| csamfile.pxd | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
| csamfile.pyx | -rw-r--r-- | 866 bytes |
| ctabix.pxd | -rw-r--r-- | 2.7 KB |
| ctabix.pyx | -rw-r--r-- | 38.5 KB |
| ctabixproxies.pxd | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
| ctabixproxies.pyx | -rw-r--r-- | 24.4 KB |
| cutils.pxd | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
| cutils.pyx | -rw-r--r-- | 10.4 KB |
| cvcf.pxd | -rw-r--r-- | 2 bytes |
| cvcf.pyx | -rw-r--r-- | 51.0 KB |
| htslib_util.c | -rw-r--r-- | 3.1 KB |
| htslib_util.h | -rw-r--r-- | 3.6 KB |
| namedtuple.py | -rw-r--r-- | 4.9 KB |
| pysam_stream.h | -rw-r--r-- | 255 bytes |
| pysam_util.c | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
| pysam_util.h | -rw-r--r-- | 791 bytes |
| samfile_util.c | -rw-r--r-- | 6.3 KB |
| samfile_util.h | -rw-r--r-- | 180 bytes |
| samtools.py | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
| tabix_util.c | -rw-r--r-- | 561 bytes |
| tabix_util.h | -rw-r--r-- | 218 bytes |
| utils.py | -rw-r--r-- | 2.9 KB |
| version.py | -rw-r--r-- | 118 bytes |
