File | Mode | Size |
---|---|---|
Allele.cpp | -rw-r--r-- | 24.1 KB |
Allele.h | -rw-r--r-- | 10.7 KB |
AlleleParser.cpp | -rw-r--r-- | 47.2 KB |
AlleleParser.h | -rw-r--r-- | 5.5 KB |
BGZF.cpp | -rw-r--r-- | 12.4 KB |
BGZF.h | -rw-r--r-- | 10.9 KB |
BamAlignment.cpp | -rw-r--r-- | 25.3 KB |
BamAlignment.h | -rw-r--r-- | 11.2 KB |
BamAux.h | -rw-r--r-- | 6.6 KB |
BamIndex.cpp | -rw-r--r-- | 44.1 KB |
BamIndex.h | -rw-r--r-- | 9.2 KB |
BamMultiReader.cpp | -rw-r--r-- | 17.8 KB |
BamMultiReader.h | -rw-r--r-- | 5.1 KB |
BamReader.cpp | -rw-r--r-- | 29.6 KB |
BamReader.h | -rw-r--r-- | 4.2 KB |
BamWriter.cpp | -rw-r--r-- | 15.3 KB |
BamWriter.h | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
BedReader.cpp | -rw-r--r-- | 732 bytes |
BedReader.h | -rw-r--r-- | 771 bytes |
DataLikelihood.cpp | -rw-r--r-- | 10.7 KB |
DataLikelihood.h | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
Dirichlet.cpp | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
Dirichlet.h | -rw-r--r-- | 569 bytes |
Fasta.cpp | -rw-r--r-- | 11.9 KB |
Fasta.h | -rw-r--r-- | 2.4 KB |
Function-Generic.cpp | -rw-r--r-- | 6.0 KB |
Function-Generic.h | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
Genotype.cpp | -rw-r--r-- | 15.6 KB |
Genotype.h | -rw-r--r-- | 4.4 KB |
GenotypePriors.cpp | -rw-r--r-- | 4.9 KB |
GenotypePriors.h | -rw-r--r-- | 650 bytes |
LICENSE | -rw-r--r-- | 1.0 KB |
LargeFileSupport.h | -rw-r--r-- | 359 bytes |
Makefile | -rw-r--r-- | 5.9 KB |
Multinomial.cpp | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
Multinomial.h | -rw-r--r-- | 237 bytes |
PLAN | -rw-r--r-- | 1.0 KB |
PLAN.completed | -rw-r--r-- | 2.7 KB |
Parameters.cpp | -rw-r--r-- | 19.5 KB |
Parameters.h | -rw-r--r-- | 2.7 KB |
Product.h | -rw-r--r-- | 357 bytes |
README | -rw-r--r-- | 6.4 KB |
ResultData.cpp | -rw-r--r-- | 12.4 KB |
ResultData.h | -rw-r--r-- | 2.2 KB |
Sum.h | -rw-r--r-- | 264 bytes |
TryCatch.h | -rw-r--r-- | 398 bytes |
Type-Hash.h | -rw-r--r-- | 4.3 KB |
Utility.cpp | -rw-r--r-- | 5.5 KB |
Utility.h | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
Version.h | -rw-r--r-- | 78 bytes |
alleles.cpp | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
convert.h | -rw-r--r-- | 319 bytes |
fastlz.c | -rw-r--r-- | 13.5 KB |
fastlz.h | -rw-r--r-- | 3.5 KB |
freebayes.cpp | -rw-r--r-- | 21.6 KB |
join.h | -rw-r--r-- | 583 bytes |
multichoose.h | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
multipermute.h | -rw-r--r-- | 3.4 KB |
split.cpp | -rw-r--r-- | 956 bytes |
split.h | -rw-r--r-- | 781 bytes |