| File | Mode | Size |
|---|---|---|
| Perl | ||
| Python | ||
| Python2 | ||
| .gitignore | -rw-r--r-- | 17 bytes |
| Makefile.am | -rw-r--r-- | 2.0 KB |
| RNA.i | -rw-r--r-- | 7.3 KB |
| aln_utils.dox | -rw-r--r-- | 594 bytes |
| aln_utils.i | -rw-r--r-- | 7.1 KB |
| basic_algorithms.dox | -rw-r--r-- | 387 bytes |
| basic_algorithms.i | -rw-r--r-- | 746 bytes |
| boltzmann_sampling.dox | -rw-r--r-- | 6.6 KB |
| boltzmann_sampling.i | -rw-r--r-- | 5.6 KB |
| classify.csv | -rw-r--r-- | 6.7 KB |
| combinatorics.dox | -rw-r--r-- | 3.3 KB |
| combinatorics.i | -rw-r--r-- | 3.3 KB |
| commands.dox | -rw-r--r-- | 471 bytes |
| commands.i | -rw-r--r-- | 2.2 KB |
| compare.i | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
| constraints.i | -rw-r--r-- | 1.7 KB |
| constraints_SHAPE.dox | -rw-r--r-- | 892 bytes |
| constraints_SHAPE.i | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
| constraints_hard.dox | -rw-r--r-- | 1022 bytes |
| constraints_hard.i | -rw-r--r-- | 4.8 KB |
| constraints_ligand.dox | -rw-r--r-- | 273 bytes |
| constraints_ligand.i | -rw-r--r-- | 602 bytes |
| constraints_soft.dox | -rw-r--r-- | 6.2 KB |
| constraints_soft.i | -rw-r--r-- | 9.5 KB |
| data_structures.i | -rw-r--r-- | 645 bytes |
| dp_matrices.i | -rw-r--r-- | 6.1 KB |
| duplex.i | -rw-r--r-- | 4.6 KB |
| eval.dox | -rw-r--r-- | 10.5 KB |
| eval.i | -rw-r--r-- | 13.8 KB |
| file_formats.dox | -rw-r--r-- | 3.2 KB |
| file_formats.i | -rw-r--r-- | 13.6 KB |
| fold_compound.dox | -rw-r--r-- | 887 bytes |
| fold_compound.i | -rw-r--r-- | 7.1 KB |
| generic.mk | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
| grammar.dox | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
| grammar.i | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
| heat_capacity.dox | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
| heat_capacity.i | -rw-r--r-- | 3.4 KB |
| ignore_list.csv | -rw-r--r-- | 2.8 KB |
| inverse.i | -rw-r--r-- | 1.8 KB |
| loops.i | -rw-r--r-- | 2.8 KB |
| mfe.dox | -rw-r--r-- | 863 bytes |
| mfe.i | -rw-r--r-- | 11.6 KB |
| mfe_window.i | -rw-r--r-- | 4.0 KB |
| model_details.dox | -rw-r--r-- | 3.7 KB |
| model_details.i | -rw-r--r-- | 11.4 KB |
| move.i | -rw-r--r-- | 2.5 KB |
| neighbor.dox | -rw-r--r-- | 330 bytes |
| neighbor.i | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
| parameter_sets.i.in | -rw-r--r-- | 333 bytes |
| params.dox | -rw-r--r-- | 4.4 KB |
| params.i | -rw-r--r-- | 12.4 KB |
| part_func.dox | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
| part_func.i | -rw-r--r-- | 13.3 KB |
| paths.dox | -rw-r--r-- | 2.8 KB |
| paths.i | -rw-r--r-- | 8.1 KB |
| pf_window.i | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
| plotting.dox | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
| plotting.i | -rw-r--r-- | 9.7 KB |
| ptr2array.i | -rw-r--r-- | 3.7 KB |
| sequence.dox | -rw-r--r-- | 473 bytes |
| sequence.i | -rw-r--r-- | 1.7 KB |
| structure_utils.dox | -rw-r--r-- | 3.3 KB |
| structure_utils.i | -rw-r--r-- | 20.2 KB |
| subopt.dox | -rw-r--r-- | 647 bytes |
| subopt.i | -rw-r--r-- | 4.7 KB |
| type_checks.i | -rw-r--r-- | 1.0 KB |
| typedefs.csv | -rw-r--r-- | 215 bytes |
| utils.dox | -rw-r--r-- | 729 bytes |
| utils.i | -rw-r--r-- | 5.8 KB |
| var_arrays.i | -rw-r--r-- | 6.7 KB |
| walk.dox | -rw-r--r-- | 994 bytes |
| walk.i | -rw-r--r-- | 4.8 KB |
