https://github.com/pysam-developers/pysam
Tip revision: 656f299afbb231062898e641079f6bf39c119cde authored by Kevin Jacobs on 24 August 2017, 14:01:55 UTC
Fix bcf_translate to operate on INFO and FORMAT values that must be freed. Also submitted upstream to htslib.
Fix bcf_translate to operate on INFO and FORMAT values that must be freed. Also submitted upstream to htslib.
Tip revision: 656f299
File | Mode | Size |
---|---|---|
include | ||
Pileup.py | -rw-r--r-- | 8.1 KB |
VCF.py.obsolete | -rw-r--r-- | 46.5 KB |
__init__.py | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
alternatives.py.obsolete | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
bcftools.py | -rw-r--r-- | 428 bytes |
cbcftools_util.h | -rw-r--r-- | 102 bytes |
csamtools_util.h | -rw-r--r-- | 102 bytes |
htslib_util.c | -rw-r--r-- | 3.2 KB |
htslib_util.h | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
libcalignedsegment.pxd | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
libcalignedsegment.pyx | -rw-r--r-- | 85.0 KB |
libcalignmentfile.pxd | -rw-r--r-- | 3.5 KB |
libcalignmentfile.pyx | -rw-r--r-- | 83.9 KB |
libcbcf.pxd | -rw-r--r-- | 3.9 KB |
libcbcf.pyx | -rw-r--r-- | 137.2 KB |
libcbcftools.pxd | -rw-r--r-- | 84 bytes |
libcbcftools.pyx | -rw-r--r-- | 28 bytes |
libcbgzf.pyx | -rw-r--r-- | 7.3 KB |
libcfaidx.pxd | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
libcfaidx.pyx | -rw-r--r-- | 18.8 KB |
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libchtslib.pyx | -rw-r--r-- | 20.4 KB |
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libcsamfile.pyx | -rw-r--r-- | 869 bytes |
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libctabix.pyx | -rw-r--r-- | 40.0 KB |
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libctabixproxies.pyx | -rw-r--r-- | 24.2 KB |
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libcutils.pyx | -rw-r--r-- | 10.9 KB |
libcvcf.pxd | -rw-r--r-- | 2 bytes |
libcvcf.pyx | -rw-r--r-- | 51.0 KB |
namedtuple.py | -rw-r--r-- | 4.9 KB |
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samtools.py | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
tabix_util.c | -rw-r--r-- | 581 bytes |
tabix_util.h | -rw-r--r-- | 218 bytes |
utils.py | -rw-r--r-- | 3.1 KB |
version.py | -rw-r--r-- | 195 bytes |