https://github.com/pysam-developers/pysam
Tip revision: 656f299afbb231062898e641079f6bf39c119cde authored by Kevin Jacobs on 24 August 2017, 14:01:55 UTC
Fix bcf_translate to operate on INFO and FORMAT values that must be freed. Also submitted upstream to htslib.
Fix bcf_translate to operate on INFO and FORMAT values that must be freed. Also submitted upstream to htslib.
Tip revision: 656f299
| File | Mode | Size |
|---|---|---|
| include | ||
| Pileup.py | -rw-r--r-- | 8.1 KB |
| VCF.py.obsolete | -rw-r--r-- | 46.5 KB |
| __init__.py | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
| alternatives.py.obsolete | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
| bcftools.py | -rw-r--r-- | 428 bytes |
| cbcftools_util.h | -rw-r--r-- | 102 bytes |
| csamtools_util.h | -rw-r--r-- | 102 bytes |
| htslib_util.c | -rw-r--r-- | 3.2 KB |
| htslib_util.h | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
| libcalignedsegment.pxd | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
| libcalignedsegment.pyx | -rw-r--r-- | 85.0 KB |
| libcalignmentfile.pxd | -rw-r--r-- | 3.5 KB |
| libcalignmentfile.pyx | -rw-r--r-- | 83.9 KB |
| libcbcf.pxd | -rw-r--r-- | 3.9 KB |
| libcbcf.pyx | -rw-r--r-- | 137.2 KB |
| libcbcftools.pxd | -rw-r--r-- | 84 bytes |
| libcbcftools.pyx | -rw-r--r-- | 28 bytes |
| libcbgzf.pyx | -rw-r--r-- | 7.3 KB |
| libcfaidx.pxd | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
| libcfaidx.pyx | -rw-r--r-- | 18.8 KB |
| libchtslib.pxd | -rw-r--r-- | 101.2 KB |
| libchtslib.pyx | -rw-r--r-- | 20.4 KB |
| libcsamfile.pxd | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
| libcsamfile.pyx | -rw-r--r-- | 869 bytes |
| libcsamtools.pxd | -rw-r--r-- | 84 bytes |
| libcsamtools.pyx | -rw-r--r-- | 28 bytes |
| libctabix.pxd | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
| libctabix.pyx | -rw-r--r-- | 40.0 KB |
| libctabixproxies.pxd | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
| libctabixproxies.pyx | -rw-r--r-- | 24.2 KB |
| libcutils.pxd | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
| libcutils.pyx | -rw-r--r-- | 10.9 KB |
| libcvcf.pxd | -rw-r--r-- | 2 bytes |
| libcvcf.pyx | -rw-r--r-- | 51.0 KB |
| namedtuple.py | -rw-r--r-- | 4.9 KB |
| pysam_stream.h | -rw-r--r-- | 255 bytes |
| pysam_util.c | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
| pysam_util.h | -rw-r--r-- | 895 bytes |
| samfile_util.c | -rw-r--r-- | 342 bytes |
| samfile_util.h | -rw-r--r-- | 80 bytes |
| samtools.py | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
| tabix_util.c | -rw-r--r-- | 581 bytes |
| tabix_util.h | -rw-r--r-- | 218 bytes |
| utils.py | -rw-r--r-- | 3.1 KB |
| version.py | -rw-r--r-- | 195 bytes |
