https://github.com/pysam-developers/pysam
Tip revision: c75e575e0f301b456459e863ef521d31ac3c01e6 authored by Andreas Heger on 13 September 2018, 20:15:05 UTC
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Tip revision: c75e575
| File | Mode | Size |
|---|---|---|
| include | ||
| Pileup.py | -rw-r--r-- | 8.8 KB |
| VCF.py.obsolete | -rw-r--r-- | 46.5 KB |
| __init__.py | -rw-r--r-- | 3.2 KB |
| alternatives.py.obsolete | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
| bcftools.py | -rw-r--r-- | 428 bytes |
| cbcftools_util.h | -rw-r--r-- | 102 bytes |
| csamtools_util.h | -rw-r--r-- | 102 bytes |
| htslib_util.c | -rw-r--r-- | 3.2 KB |
| htslib_util.h | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
| libcalignedsegment.pxd | -rw-r--r-- | 2.9 KB |
| libcalignedsegment.pyx | -rw-r--r-- | 106.9 KB |
| libcalignmentfile.pxd | -rw-r--r-- | 3.6 KB |
| libcalignmentfile.pyx | -rw-r--r-- | 97.7 KB |
| libcbcf.pxd | -rw-r--r-- | 3.9 KB |
| libcbcf.pyx | -rw-r--r-- | 138.7 KB |
| libcbcftools.pxd | -rw-r--r-- | 304 bytes |
| libcbcftools.pyx | -rw-r--r-- | 28 bytes |
| libcbgzf.pyx | -rw-r--r-- | 7.3 KB |
| libcfaidx.pxd | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
| libcfaidx.pyx | -rw-r--r-- | 20.4 KB |
| libchtslib.pxd | -rw-r--r-- | 102.2 KB |
| libchtslib.pyx | -rw-r--r-- | 22.0 KB |
| libcsamfile.pxd | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
| libcsamfile.pyx | -rw-r--r-- | 869 bytes |
| libcsamtools.pxd | -rw-r--r-- | 304 bytes |
| libcsamtools.pyx | -rw-r--r-- | 28 bytes |
| libctabix.pxd | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
| libctabix.pyx | -rw-r--r-- | 42.4 KB |
| libctabixproxies.pxd | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
| libctabixproxies.pyx | -rw-r--r-- | 24.4 KB |
| libcutils.pxd | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
| libcutils.pyx | -rw-r--r-- | 12.0 KB |
| libcvcf.pxd | -rw-r--r-- | 2 bytes |
| libcvcf.pyx | -rw-r--r-- | 51.0 KB |
| pysam_stream.h | -rw-r--r-- | 255 bytes |
| pysam_util.c | -rw-r--r-- | 704 bytes |
| pysam_util.h | -rw-r--r-- | 51 bytes |
| samtools.py | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
| utils.py | -rw-r--r-- | 3.1 KB |
| version.py | -rw-r--r-- | 197 bytes |
