https://github.com/pysam-developers/pysam
Tip revision: b76df753e4814daa5af256323e623875c69ce81a authored by Andreas Heger on 23 June 2016, 20:14:15 UTC
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Tip revision: b76df75
| File | Mode | Size |
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| __init__.py | -rw-r--r-- | 3.1 KB |
| alternatives.py.obsolete | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
| bcftools.py | -rw-r--r-- | 428 bytes |
| calignedsegment.pxd | -rw-r--r-- | 2.9 KB |
| calignedsegment.pyx | -rw-r--r-- | 80.0 KB |
| calignmentfile.pxd | -rw-r--r-- | 3.9 KB |
| calignmentfile.pyx | -rw-r--r-- | 83.5 KB |
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| cbcf.pyx | -rw-r--r-- | 117.9 KB |
| cfaidx.pxd | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
| cfaidx.pyx | -rw-r--r-- | 17.0 KB |
| chtslib.pxd | -rw-r--r-- | 78.4 KB |
| chtslib.pyx | -rw-r--r-- | 455 bytes |
| csamfile.pxd | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
| csamfile.pyx | -rw-r--r-- | 866 bytes |
| ctabix.pxd | -rw-r--r-- | 2.7 KB |
| ctabix.pyx | -rw-r--r-- | 38.5 KB |
| ctabixproxies.pxd | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
| ctabixproxies.pyx | -rw-r--r-- | 24.4 KB |
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| cutils.pyx | -rw-r--r-- | 10.4 KB |
| cvcf.pxd | -rw-r--r-- | 2 bytes |
| cvcf.pyx | -rw-r--r-- | 51.0 KB |
| htslib_util.c | -rw-r--r-- | 3.1 KB |
| htslib_util.h | -rw-r--r-- | 3.6 KB |
| namedtuple.py | -rw-r--r-- | 4.9 KB |
| pysam_stream.h | -rw-r--r-- | 255 bytes |
| pysam_util.c | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
| pysam_util.h | -rw-r--r-- | 791 bytes |
| samfile_util.c | -rw-r--r-- | 6.3 KB |
| samfile_util.h | -rw-r--r-- | 180 bytes |
| samtools.py | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
| tabix_util.c | -rw-r--r-- | 561 bytes |
| tabix_util.h | -rw-r--r-- | 218 bytes |
| utils.py | -rw-r--r-- | 2.9 KB |
| version.py | -rw-r--r-- | 118 bytes |
