https://github.com/pysam-developers/pysam
Tip revision: 9218de6bb523f43667520fde740067124c48745f authored by Andreas Heger on 09 April 2023, 21:52:23 UTC
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Tip revision: 9218de6
| File | Mode | Size |
|---|---|---|
| include | ||
| Pileup.py | -rw-r--r-- | 8.7 KB |
| VCF.py.obsolete | -rw-r--r-- | 46.5 KB |
| __init__.py | -rw-r--r-- | 3.4 KB |
| alternatives.py.obsolete | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
| bcftools.py | -rw-r--r-- | 2.0 KB |
| cbcftools_util.h | -rw-r--r-- | 102 bytes |
| csamtools_util.h | -rw-r--r-- | 102 bytes |
| htslib_util.c | -rw-r--r-- | 3.2 KB |
| htslib_util.h | -rw-r--r-- | 2.5 KB |
| libcalignedsegment.pxd | -rw-r--r-- | 2.9 KB |
| libcalignedsegment.pyi | -rw-r--r-- | 6.1 KB |
| libcalignedsegment.pyx | -rw-r--r-- | 111.7 KB |
| libcalignmentfile.pxd | -rw-r--r-- | 3.5 KB |
| libcalignmentfile.pyi | -rw-r--r-- | 7.4 KB |
| libcalignmentfile.pyx | -rw-r--r-- | 102.0 KB |
| libcbcf.pxd | -rw-r--r-- | 4.0 KB |
| libcbcf.pyi | -rw-r--r-- | 11.5 KB |
| libcbcf.pyx | -rw-r--r-- | 142.6 KB |
| libcbcftools.pxd | -rw-r--r-- | 301 bytes |
| libcbcftools.pyi | -rw-r--r-- | 31 bytes |
| libcbcftools.pyx | -rw-r--r-- | 28 bytes |
| libcbgzf.pyi | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
| libcbgzf.pyx | -rw-r--r-- | 7.3 KB |
| libcfaidx.pxd | -rw-r--r-- | 2.2 KB |
| libcfaidx.pyi | -rw-r--r-- | 2.5 KB |
| libcfaidx.pyx | -rw-r--r-- | 20.7 KB |
| libchtslib.pxd | -rw-r--r-- | 105.5 KB |
| libchtslib.pyi | -rw-r--r-- | 3.6 KB |
| libchtslib.pyx | -rw-r--r-- | 22.0 KB |
| libcsamfile.pxd | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
| libcsamfile.pyi | -rw-r--r-- | 176 bytes |
| libcsamfile.pyx | -rw-r--r-- | 822 bytes |
| libcsamtools.pxd | -rw-r--r-- | 301 bytes |
| libcsamtools.pyi | -rw-r--r-- | 31 bytes |
| libcsamtools.pyx | -rw-r--r-- | 28 bytes |
| libctabix.pxd | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
| libctabix.pyi | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
| libctabix.pyx | -rw-r--r-- | 41.5 KB |
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| libctabixproxies.pyx | -rw-r--r-- | 24.5 KB |
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| libcutils.pyi | -rw-r--r-- | 973 bytes |
| libcutils.pyx | -rw-r--r-- | 13.3 KB |
| libcvcf.pxd | -rw-r--r-- | 28 bytes |
| libcvcf.pyi | -rw-r--r-- | 0 bytes |
| libcvcf.pyx | -rw-r--r-- | 51.0 KB |
| py.typed | -rw-r--r-- | 0 bytes |
| pysam_stream.h | -rw-r--r-- | 255 bytes |
| pysam_util.c | -rw-r--r-- | 704 bytes |
| pysam_util.h | -rw-r--r-- | 51 bytes |
| samtools.py | -rw-r--r-- | 7.6 KB |
| utils.py | -rw-r--r-- | 3.7 KB |
| version.h | -rw-r--r-- | 196 bytes |
| version.py | -rw-r--r-- | 143 bytes |
| version.pyi | -rw-r--r-- | 93 bytes |
