https://github.com/AndySouth/resistance
History
Tip revision: 1265a1018534875ec7932ae427b956c6e74d2634 authored by AndySouth on 11 November 2020, 10:17:52 UTC
rerun linkage dis plots
Tip revision: 1265a10
File Mode Size
HW.r -rw-r--r-- 357 bytes
array_named.r -rw-r--r-- 1.5 KB
calc_fit_rs.r -rw-r--r-- 2.5 KB
createGametes.r -rw-r--r-- 4.4 KB
createInputMatrix.r -rw-r--r-- 19.9 KB
findResistancePoints.r -rw-r--r-- 3.6 KB
findResistancePointsMixResponsive.r -rw-r--r-- 5.3 KB
fit_time_genotype.r -rw-r--r-- 5.9 KB
fitnessGenotype.r -rw-r--r-- 4.3 KB
fitnessNiche.r -rw-r--r-- 3.4 KB
fitnessOutput.r -rw-r--r-- 1.6 KB
fitnessPrint.r -rw-r--r-- 4.1 KB
fitnessSingleLocus.r -rw-r--r-- 4.1 KB
genotypesLong2Short.r -rw-r--r-- 1.6 KB
get_resistance.R -rw-r--r-- 2.7 KB
inputs_from_gen_fit.r -rw-r--r-- 3.1 KB
linkage_calc.r -rw-r--r-- 3.6 KB
make.genotypemat.r -rw-r--r-- 1.3 KB
make.matrix.r -rw-r--r-- 657 bytes
plot_exposure.r -rw-r--r-- 3.2 KB
plot_fit_calc.r -rw-r--r-- 9.3 KB
plot_fit_rs.r -rw-r--r-- 3.4 KB
plot_fit_variance.r -rw-r--r-- 3.1 KB
plot_ld_gpirm.r -rw-r--r-- 7.0 KB
plot_outputs_all.r -rw-r--r-- 1.1 KB
plotallele.freq.andy.r -rw-r--r-- 4.7 KB
plotallele.freq.r -rw-r--r-- 1.0 KB
plotcurtis_f1.r -rw-r--r-- 2.1 KB
plotcurtis_f2.r -rw-r--r-- 3.1 KB
plotcurtis_f2_generic.r -rw-r--r-- 11.8 KB
plotcurtis_ld.r -rw-r--r-- 1.6 KB
plothaplotype.r -rw-r--r-- 2.2 KB
plotlinkage.r -rw-r--r-- 2.6 KB
plotsimpfit.r -rw-r--r-- 2.6 KB
randomMating.r -rw-r--r-- 6.0 KB
relaxSelection.r -rw-r--r-- 696 bytes
resistSimple.r -rw-r--r-- 1.8 KB
resistance-package.r -rw-r--r-- 635 bytes
resistanceMaster.r -rw-r--r-- 5.2 KB
resistance_freq_count.r -rw-r--r-- 2.1 KB
runModel.r -rw-r--r-- 51.5 KB
runModel2.r -rw-r--r-- 9.8 KB
runUIs.R -rw-r--r-- 2.6 KB
runcurtis_f2.r -rw-r--r-- 11.9 KB
selection.r -rw-r--r-- 2.6 KB
selection_simple.r -rw-r--r-- 1.6 KB
sensiAn1.r -rw-r--r-- 3.9 KB
sensiAnPaperPart.r -rw-r--r-- 5.9 KB
sensiAnPaperPartOneAtATime.r -rw-r--r-- 3.9 KB
setExposure.r -rw-r--r-- 4.9 KB
setExposureFromInput.r -rw-r--r-- 1.9 KB
setInputOneScenario.r -rw-r--r-- 11.4 KB
setInputSensiScenarios.r -rw-r--r-- 3.0 KB
singlealleleFrequency.r -rw-r--r-- 1.9 KB
timetoFifty.r -rw-r--r-- 1.7 KB

back to top