https://github.com/ekg/freebayes
Tip revision: 0c1b1c68bef00a90d457bc665cae153cb8cd819b authored by Erik Garrison on 07 January 2020, 15:56:31 UTC
two cores on travis
two cores on travis
Tip revision: 0c1b1c6
File | Mode | Size |
---|---|---|
.gitignore | -rw-r--r-- | 21 bytes |
Allele.cpp | -rw-r--r-- | 46.5 KB |
Allele.h | -rw-r--r-- | 15.2 KB |
AlleleParser.cpp | -rw-r--r-- | 188.5 KB |
AlleleParser.h | -rw-r--r-- | 12.9 KB |
BGZF.cpp | -rw-r--r-- | 12.4 KB |
BGZF.h | -rw-r--r-- | 10.9 KB |
BedReader.cpp | -rw-r--r-- | 2.4 KB |
BedReader.h | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
Bias.cpp | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
Bias.h | -rw-r--r-- | 426 bytes |
CNV.cpp | -rw-r--r-- | 2.7 KB |
CNV.h | -rw-r--r-- | 858 bytes |
Contamination.cpp | -rw-r--r-- | 2.0 KB |
Contamination.h | -rw-r--r-- | 1.0 KB |
DataLikelihood.cpp | -rw-r--r-- | 12.8 KB |
DataLikelihood.h | -rw-r--r-- | 1.7 KB |
Dirichlet.cpp | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
Dirichlet.h | -rw-r--r-- | 569 bytes |
Ewens.cpp | -rw-r--r-- | 1.7 KB |
Ewens.h | -rw-r--r-- | 901 bytes |
Fasta.cpp | -rw-r--r-- | 12.6 KB |
Fasta.h | -rw-r--r-- | 2.5 KB |
Genotype.cpp | -rw-r--r-- | 67.3 KB |
Genotype.h | -rw-r--r-- | 14.8 KB |
GenotypePriors.cpp | -rw-r--r-- | 7.4 KB |
GenotypePriors.h | -rw-r--r-- | 1.8 KB |
IndelAllele.cpp | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
IndelAllele.h | -rw-r--r-- | 1.0 KB |
LargeFileSupport.h | -rw-r--r-- | 481 bytes |
LeftAlign.cpp | -rw-r--r-- | 16.9 KB |
LeftAlign.h | -rw-r--r-- | 3.5 KB |
Logging.h | -rw-r--r-- | 557 bytes |
Marginals.cpp | -rw-r--r-- | 8.4 KB |
Marginals.h | -rw-r--r-- | 825 bytes |
Multinomial.cpp | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
Multinomial.h | -rw-r--r-- | 448 bytes |
NonCall.cpp | -rw-r--r-- | 3.5 KB |
NonCall.h | -rw-r--r-- | 1.0 KB |
Parameters.cpp | -rw-r--r-- | 49.6 KB |
Parameters.h | -rw-r--r-- | 5.0 KB |
Product.h | -rw-r--r-- | 357 bytes |
Result.cpp | -rw-r--r-- | 168 bytes |
Result.h | -rw-r--r-- | 379 bytes |
ResultData.cpp | -rw-r--r-- | 32.7 KB |
ResultData.h | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
Sample.cpp | -rw-r--r-- | 15.6 KB |
Sample.h | -rw-r--r-- | 4.0 KB |
SegfaultHandler.cpp | -rw-r--r-- | 433 bytes |
SegfaultHandler.h | -rw-r--r-- | 200 bytes |
Sum.h | -rw-r--r-- | 264 bytes |
TryCatch.h | -rw-r--r-- | 398 bytes |
Utility.cpp | -rw-r--r-- | 2.3 MB |
Utility.h | -rw-r--r-- | 4.8 KB |
Version.h | -rw-r--r-- | 78 bytes |
alleles.cpp | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
bamfiltertech.cpp | -rw-r--r-- | 3.3 KB |
bamleftalign.cpp | -rw-r--r-- | 6.1 KB |
convert.h | -rw-r--r-- | 470 bytes |
dummy.cpp | -rw-r--r-- | 833 bytes |
fastlz.c | -rw-r--r-- | 13.5 KB |
fastlz.h | -rw-r--r-- | 3.5 KB |
freebayes.cpp | -rw-r--r-- | 29.7 KB |
join.h | -rw-r--r-- | 626 bytes |
levenshtein.cpp | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
multichoose.h | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
multipermute.h | -rw-r--r-- | 4.5 KB |
split.cpp | -rw-r--r-- | 956 bytes |
split.h | -rw-r--r-- | 781 bytes |
version_release.txt | -rw-r--r-- | 171 bytes |