https://github.com/ekg/freebayes
Tip revision: 1635a15917a444bb6aed9cba457b6a192f1f4962 authored by Erik Garrison on 06 March 2015, 17:56:48 UTC
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Tip revision: 1635a15
| File | Mode | Size |
|---|---|---|
| .gitignore | -rw-r--r-- | 21 bytes |
| Allele.cpp | -rw-r--r-- | 46.9 KB |
| Allele.h | -rw-r--r-- | 15.2 KB |
| AlleleParser.cpp | -rw-r--r-- | 189.2 KB |
| AlleleParser.h | -rw-r--r-- | 12.7 KB |
| BGZF.cpp | -rw-r--r-- | 12.4 KB |
| BGZF.h | -rw-r--r-- | 10.9 KB |
| BedReader.cpp | -rw-r--r-- | 2.4 KB |
| BedReader.h | -rw-r--r-- | 1.8 KB |
| Bias.cpp | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
| Bias.h | -rw-r--r-- | 426 bytes |
| CNV.cpp | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
| CNV.h | -rw-r--r-- | 763 bytes |
| Contamination.cpp | -rw-r--r-- | 2.0 KB |
| Contamination.h | -rw-r--r-- | 1.0 KB |
| DataLikelihood.cpp | -rw-r--r-- | 8.4 KB |
| DataLikelihood.h | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
| Dirichlet.cpp | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
| Dirichlet.h | -rw-r--r-- | 569 bytes |
| Ewens.cpp | -rw-r--r-- | 1.7 KB |
| Ewens.h | -rw-r--r-- | 901 bytes |
| Fasta.cpp | -rw-r--r-- | 12.0 KB |
| Fasta.h | -rw-r--r-- | 2.4 KB |
| Genotype.cpp | -rw-r--r-- | 67.3 KB |
| Genotype.h | -rw-r--r-- | 14.8 KB |
| GenotypePriors.cpp | -rw-r--r-- | 7.4 KB |
| GenotypePriors.h | -rw-r--r-- | 1.8 KB |
| IndelAllele.cpp | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
| IndelAllele.h | -rw-r--r-- | 1017 bytes |
| LargeFileSupport.h | -rw-r--r-- | 359 bytes |
| LeftAlign.cpp | -rw-r--r-- | 15.5 KB |
| LeftAlign.h | -rw-r--r-- | 845 bytes |
| Makefile | -rw-r--r-- | 8.4 KB |
| Marginals.cpp | -rw-r--r-- | 8.4 KB |
| Marginals.h | -rw-r--r-- | 825 bytes |
| Multinomial.cpp | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
| Multinomial.h | -rw-r--r-- | 448 bytes |
| Parameters.cpp | -rw-r--r-- | 45.7 KB |
| Parameters.h | -rw-r--r-- | 4.9 KB |
| Product.h | -rw-r--r-- | 357 bytes |
| Result.cpp | -rw-r--r-- | 168 bytes |
| Result.h | -rw-r--r-- | 379 bytes |
| ResultData.cpp | -rw-r--r-- | 29.3 KB |
| ResultData.h | -rw-r--r-- | 2.0 KB |
| Sample.cpp | -rw-r--r-- | 15.6 KB |
| Sample.h | -rw-r--r-- | 4.0 KB |
| SegfaultHandler.cpp | -rw-r--r-- | 407 bytes |
| SegfaultHandler.h | -rw-r--r-- | 174 bytes |
| Sum.h | -rw-r--r-- | 264 bytes |
| TryCatch.h | -rw-r--r-- | 398 bytes |
| Utility.cpp | -rw-r--r-- | 2.3 MB |
| Utility.h | -rw-r--r-- | 4.8 KB |
| Version.h | -rw-r--r-- | 78 bytes |
| alleles.cpp | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
| bamfiltertech.cpp | -rw-r--r-- | 3.3 KB |
| bamleftalign.cpp | -rw-r--r-- | 5.9 KB |
| convert.h | -rw-r--r-- | 470 bytes |
| dummy.cpp | -rw-r--r-- | 833 bytes |
| fastlz.c | -rw-r--r-- | 13.5 KB |
| fastlz.h | -rw-r--r-- | 3.5 KB |
| freebayes.cpp | -rw-r--r-- | 33.4 KB |
| join.h | -rw-r--r-- | 626 bytes |
| levenshtein.cpp | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
| multichoose.h | -rw-r--r-- | 2.1 KB |
| multipermute.h | -rw-r--r-- | 4.5 KB |
| split.cpp | -rw-r--r-- | 956 bytes |
| split.h | -rw-r--r-- | 781 bytes |
| version_release.txt | -rw-r--r-- | 173 bytes |
