https://github.com/ekg/freebayes
Tip revision: 04d702cdb8098449bade25e27ca17df983fa3ead authored by Erik Garrison on 25 May 2010, 21:44:14 UTC
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Tip revision: 04d702c
| File | Mode | Size |
|---|---|---|
| Allele.cpp | -rw-r--r-- | 13.0 KB |
| Allele.h | -rw-r--r-- | 6.7 KB |
| BGZF.cpp | -rw-r--r-- | 10.9 KB |
| BGZF.h | -rw-r--r-- | 5.9 KB |
| BamAux.h | -rw-r--r-- | 21.3 KB |
| BamMultiReader.cpp | -rw-r--r-- | 12.1 KB |
| BamMultiReader.h | -rw-r--r-- | 4.0 KB |
| BamReader.cpp | -rw-r--r-- | 39.2 KB |
| BamReader.h | -rw-r--r-- | 2.8 KB |
| BamWriter.cpp | -rw-r--r-- | 12.5 KB |
| BamWriter.h | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
| Caller.cpp | -rw-r--r-- | 44.2 KB |
| Caller.h | -rw-r--r-- | 6.0 KB |
| Class-BedReader.cpp | -rw-r--r-- | 6.8 KB |
| Class-BedReader.h | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
| Class-FastaReader.cpp | -rw-r--r-- | 8.8 KB |
| Class-FastaReader.h | -rw-r--r-- | 3.1 KB |
| Class-GigReader.cpp | -rw-r--r-- | 24.5 KB |
| Class-GigReader.h | -rw-r--r-- | 5.6 KB |
| Fasta.cpp | -rw-r--r-- | 12.0 KB |
| Fasta.h | -rw-r--r-- | 2.4 KB |
| Function-Generic.cpp | -rw-r--r-- | 6.0 KB |
| Function-Generic.h | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
| Function-Math.cpp | -rw-r--r-- | 133.0 KB |
| Function-Math.h | -rw-r--r-- | 6.9 KB |
| Function-Sequence.cpp | -rw-r--r-- | 23.2 KB |
| Function-Sequence.h | -rw-r--r-- | 8.4 KB |
| LargeFileSupport.h | -rw-r--r-- | 240 bytes |
| Makefile | -rw-r--r-- | 9.3 KB |
| PLAN | -rw-r--r-- | 2.7 KB |
| Parameters.cpp | -rw-r--r-- | 26.4 KB |
| Parameters.h | -rw-r--r-- | 2.3 KB |
| README | -rw-r--r-- | 6.4 KB |
| ReferenceSequenceReader.cpp | -rw-r--r-- | 14.3 KB |
| ReferenceSequenceReader.h | -rw-r--r-- | 4.4 KB |
| TryCatch.h | -rw-r--r-- | 398 bytes |
| Type-Hash.h | -rw-r--r-- | 4.3 KB |
| Utility.cpp | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
| Utility.h | -rw-r--r-- | 596 bytes |
| aggregateHapmap.cpp | -rw-r--r-- | 24.8 KB |
| bamBayes.cpp | -rw-r--r-- | 99.9 KB |
| bamDump.cpp | -rw-r--r-- | 24.0 KB |
| bamDup.cpp | -rw-r--r-- | 35.7 KB |
| bamIndel.cpp | -rw-r--r-- | 64.0 KB |
| bamSlice.cpp | -rw-r--r-- | 41.6 KB |
| bamStat.cpp | -rw-r--r-- | 38.8 KB |
| bayes.cpp | -rw-r--r-- | 7.7 KB |
| fastlz.c | -rw-r--r-- | 13.5 KB |
| fastlz.h | -rw-r--r-- | 3.5 KB |
| gigaBayes.cpp | -rw-r--r-- | 100.6 KB |
| gigaBuild.cpp | -rw-r--r-- | 71.5 KB |
| gigaDump.cpp | -rw-r--r-- | 31.0 KB |
| multichoose.h | -rw-r--r-- | 2.9 KB |
| rptSum.cpp | -rw-r--r-- | 93.9 KB |
| snpFilter.pl | -rwxr-xr-x | 4.5 KB |
| snpRate.pl | -rwxr-xr-x | 205 bytes |
| testMath.cpp | -rw-r--r-- | 15.2 KB |
