https://github.com/ekg/freebayes
Tip revision: e612563285f45dfb925c0be23f5bf5719100ae01 authored by Erik Garrison on 13 October 2010, 22:04:11 UTC
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Tip revision: e612563
| File | Mode | Size |
|---|---|---|
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| Allele.h | -rw-r--r-- | 10.7 KB |
| AlleleParser.cpp | -rw-r--r-- | 47.2 KB |
| AlleleParser.h | -rw-r--r-- | 5.5 KB |
| BGZF.cpp | -rw-r--r-- | 12.4 KB |
| BGZF.h | -rw-r--r-- | 10.9 KB |
| BamAlignment.cpp | -rw-r--r-- | 25.3 KB |
| BamAlignment.h | -rw-r--r-- | 11.2 KB |
| BamAux.h | -rw-r--r-- | 6.6 KB |
| BamIndex.cpp | -rw-r--r-- | 44.1 KB |
| BamIndex.h | -rw-r--r-- | 9.2 KB |
| BamMultiReader.cpp | -rw-r--r-- | 17.8 KB |
| BamMultiReader.h | -rw-r--r-- | 5.1 KB |
| BamReader.cpp | -rw-r--r-- | 29.6 KB |
| BamReader.h | -rw-r--r-- | 4.2 KB |
| BamWriter.cpp | -rw-r--r-- | 15.3 KB |
| BamWriter.h | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
| BedReader.cpp | -rw-r--r-- | 732 bytes |
| BedReader.h | -rw-r--r-- | 771 bytes |
| DataLikelihood.cpp | -rw-r--r-- | 10.7 KB |
| DataLikelihood.h | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
| Dirichlet.cpp | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
| Dirichlet.h | -rw-r--r-- | 569 bytes |
| Fasta.cpp | -rw-r--r-- | 11.9 KB |
| Fasta.h | -rw-r--r-- | 2.4 KB |
| Function-Generic.cpp | -rw-r--r-- | 6.0 KB |
| Function-Generic.h | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
| Genotype.cpp | -rw-r--r-- | 15.6 KB |
| Genotype.h | -rw-r--r-- | 4.4 KB |
| GenotypePriors.cpp | -rw-r--r-- | 4.9 KB |
| GenotypePriors.h | -rw-r--r-- | 650 bytes |
| LICENSE | -rw-r--r-- | 1.0 KB |
| LargeFileSupport.h | -rw-r--r-- | 359 bytes |
| Makefile | -rw-r--r-- | 5.9 KB |
| Multinomial.cpp | -rw-r--r-- | 1.1 KB |
| Multinomial.h | -rw-r--r-- | 237 bytes |
| PLAN | -rw-r--r-- | 1.0 KB |
| PLAN.completed | -rw-r--r-- | 2.7 KB |
| Parameters.cpp | -rw-r--r-- | 19.5 KB |
| Parameters.h | -rw-r--r-- | 2.7 KB |
| Product.h | -rw-r--r-- | 357 bytes |
| README | -rw-r--r-- | 6.4 KB |
| ResultData.cpp | -rw-r--r-- | 12.4 KB |
| ResultData.h | -rw-r--r-- | 2.2 KB |
| Sum.h | -rw-r--r-- | 264 bytes |
| TryCatch.h | -rw-r--r-- | 398 bytes |
| Type-Hash.h | -rw-r--r-- | 4.3 KB |
| Utility.cpp | -rw-r--r-- | 5.5 KB |
| Utility.h | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
| Version.h | -rw-r--r-- | 78 bytes |
| alleles.cpp | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
| convert.h | -rw-r--r-- | 319 bytes |
| fastlz.c | -rw-r--r-- | 13.5 KB |
| fastlz.h | -rw-r--r-- | 3.5 KB |
| freebayes.cpp | -rw-r--r-- | 21.6 KB |
| join.h | -rw-r--r-- | 583 bytes |
| multichoose.h | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
| multipermute.h | -rw-r--r-- | 3.4 KB |
| split.cpp | -rw-r--r-- | 956 bytes |
| split.h | -rw-r--r-- | 781 bytes |
