https://github.com/samtools/samtools
History
Tip revision: c9ae5d467cb5bf88e1c5cffaf881c2f0825c9be7 authored by Petr Danecek on 08 September 2014, 10:53:02 UTC
Reflect hts_file_type change in htslib
Tip revision: c9ae5d4
File Mode Size
examples
misc
test
win32
.gitattributes -rw-r--r-- 345 bytes
.gitignore -rw-r--r-- 178 bytes
.travis.yml -rw-r--r-- 419 bytes
AUTHORS -rw-r--r-- 828 bytes
ChangeLog.old -rw-r--r-- 113.6 KB
INSTALL -rw-r--r-- 2.0 KB
LICENSE -rw-r--r-- 1.7 KB
Makefile -rw-r--r-- 12.3 KB
Makefile.mingw -rw-r--r-- 2.0 KB
NEWS -rw-r--r-- 27.8 KB
README -rw-r--r-- 260 bytes
README.md -rw-r--r-- 481 bytes
bam.c -rw-r--r-- 7.4 KB
bam.h -rw-r--r-- 20.3 KB
bam2bcf.c -rw-r--r-- 29.0 KB
bam2bcf.h -rw-r--r-- 4.8 KB
bam2bcf_indel.c -rw-r--r-- 23.4 KB
bam2depth.c -rw-r--r-- 8.1 KB
bam_aux.c -rw-r--r-- 2.5 KB
bam_cat.c -rw-r--r-- 5.2 KB
bam_color.c -rw-r--r-- 4.8 KB
bam_endian.h -rw-r--r-- 2.2 KB
bam_flags.c -rw-r--r-- 3.1 KB
bam_import.c -rw-r--r-- 2.2 KB
bam_index.c -rw-r--r-- 3.6 KB
bam_lpileup.c -rw-r--r-- 6.8 KB
bam_lpileup.h -rw-r--r-- 2.0 KB
bam_mate.c -rw-r--r-- 13.2 KB
bam_md.c -rw-r--r-- 16.3 KB
bam_plbuf.c -rw-r--r-- 2.1 KB
bam_plbuf.h -rw-r--r-- 1.8 KB
bam_plcmd.c -rw-r--r-- 37.5 KB
bam_reheader.c -rw-r--r-- 2.7 KB
bam_rmdup.c -rw-r--r-- 7.6 KB
bam_rmdupse.c -rw-r--r-- 6.0 KB
bam_sort.c -rw-r--r-- 44.7 KB
bam_split.c -rw-r--r-- 16.3 KB
bam_stat.c -rw-r--r-- 5.5 KB
bam_tview.c -rw-r--r-- 16.1 KB
bam_tview.h -rw-r--r-- 3.3 KB
bam_tview_curses.c -rw-r--r-- 10.2 KB
bam_tview_html.c -rw-r--r-- 10.5 KB
bamshuf.c -rw-r--r-- 5.2 KB
bamtk.c -rw-r--r-- 8.1 KB
bedcov.c -rw-r--r-- 4.9 KB
bedidx.c -rw-r--r-- 8.5 KB
cut_target.c -rw-r--r-- 7.8 KB
errmod.c -rw-r--r-- 6.2 KB
errmod.h -rw-r--r-- 1.6 KB
faidx.c -rw-r--r-- 2.6 KB
kaln.c -rw-r--r-- 14.9 KB
kaln.h -rw-r--r-- 2.0 KB
kprobaln.c -rw-r--r-- 10.4 KB
kprobaln.h -rw-r--r-- 1.5 KB
padding.c -rw-r--r-- 21.2 KB
phase.c -rw-r--r-- 25.6 KB
sam.c -rw-r--r-- 3.7 KB
sam.h -rw-r--r-- 4.1 KB
sam_header.c -rw-r--r-- 22.0 KB
sam_header.h -rw-r--r-- 2.7 KB
sam_view.c -rw-r--r-- 25.6 KB
sample.c -rw-r--r-- 4.4 KB
sample.h -rw-r--r-- 1.5 KB
samtools.1 -rw-r--r-- 32.8 KB
samtools.h -rw-r--r-- 1.3 KB
stats.c -rw-r--r-- 61.5 KB
stats_isize.c -rw-r--r-- 7.4 KB
stats_isize.h -rw-r--r-- 2.4 KB

README.md

back to top