https://github.com/lh3/bwa
Tip revision: 8d7dc341501575f15eca0071f6435ed737fcca48 authored by Heng Li on 12 November 2011, 21:58:38 UTC
the same bug fixed by John Marshall
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Tip revision: 8d7dc34
| File | Mode | Size |
|---|---|---|
| bwt_gen | ||
| .gitignore | -rw-r--r-- | 23 bytes |
| COPYING | -rw-r--r-- | 34.3 KB |
| ChangeLog | -rw-r--r-- | 122.7 KB |
| Makefile | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
| NEWS | -rw-r--r-- | 15.3 KB |
| README | -rw-r--r-- | 634 bytes |
| bamlite.c | -rw-r--r-- | 4.5 KB |
| bamlite.h | -rw-r--r-- | 2.4 KB |
| bntseq.c | -rw-r--r-- | 9.0 KB |
| bntseq.h | -rw-r--r-- | 2.2 KB |
| bwa.1 | -rw-r--r-- | 18.4 KB |
| bwape.c | -rw-r--r-- | 29.3 KB |
| bwase.c | -rw-r--r-- | 21.3 KB |
| bwase.h | -rw-r--r-- | 960 bytes |
| bwaseqio.c | -rw-r--r-- | 6.5 KB |
| bwt.c | -rw-r--r-- | 7.6 KB |
| bwt.h | -rw-r--r-- | 3.5 KB |
| bwt_lite.c | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
| bwt_lite.h | -rw-r--r-- | 674 bytes |
| bwtaln.c | -rw-r--r-- | 11.5 KB |
| bwtaln.h | -rw-r--r-- | 3.9 KB |
| bwtgap.c | -rw-r--r-- | 8.9 KB |
| bwtgap.h | -rw-r--r-- | 942 bytes |
| bwtindex.c | -rw-r--r-- | 6.6 KB |
| bwtio.c | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
| bwtmisc.c | -rw-r--r-- | 6.7 KB |
| bwtsw2.h | -rw-r--r-- | 977 bytes |
| bwtsw2_aux.c | -rw-r--r-- | 19.3 KB |
| bwtsw2_chain.c | -rw-r--r-- | 2.5 KB |
| bwtsw2_core.c | -rw-r--r-- | 17.4 KB |
| bwtsw2_main.c | -rw-r--r-- | 3.8 KB |
| cs2nt.c | -rw-r--r-- | 5.8 KB |
| is.c | -rw-r--r-- | 6.4 KB |
| khash.h | -rw-r--r-- | 16.5 KB |
| kseq.h | -rw-r--r-- | 7.3 KB |
| ksort.h | -rw-r--r-- | 9.4 KB |
| kstring.c | -rw-r--r-- | 641 bytes |
| kstring.h | -rw-r--r-- | 825 bytes |
| kvec.h | -rw-r--r-- | 2.8 KB |
| main.c | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
| main.h | -rw-r--r-- | 668 bytes |
| qualfa2fq.pl | -rwxr-xr-x | 616 bytes |
| simple_dp.c | -rw-r--r-- | 5.0 KB |
| solid2fastq.pl | -rwxr-xr-x | 3.1 KB |
| stdaln.c | -rw-r--r-- | 35.4 KB |
| stdaln.h | -rw-r--r-- | 4.6 KB |
| utils.c | -rw-r--r-- | 3.7 KB |
| utils.h | -rw-r--r-- | 2.5 KB |
| xa2multi.pl | -rwxr-xr-x | 730 bytes |
