https://github.com/lh3/bwa
Tip revision: 4c3e1cc8fc21e0535124d57435953a5157a29188 authored by Heng Li on 04 August 2017, 20:36:11 UTC
Merge branch 'dev' into mem
Merge branch 'dev' into mem
Tip revision: 4c3e1cc
| File | Mode | Size |
|---|---|---|
| bwakit | ||
| .gitignore | -rw-r--r-- | 55 bytes |
| .travis.yml | -rw-r--r-- | 53 bytes |
| ChangeLog | -rw-r--r-- | 122.7 KB |
| LICENSE.txt | -rw-r--r-- | 9.4 KB |
| Makefile | -rw-r--r-- | 1.8 KB |
| NEWS.md | -rw-r--r-- | 39.1 KB |
| README-alt.md | -rw-r--r-- | 9.2 KB |
| README.md | -rw-r--r-- | 8.2 KB |
| bntseq.c | -rw-r--r-- | 13.5 KB |
| bntseq.h | -rw-r--r-- | 2.7 KB |
| bwa.1 | -rw-r--r-- | 26.6 KB |
| bwa.c | -rw-r--r-- | 13.8 KB |
| bwa.h | -rw-r--r-- | 2.0 KB |
| bwamem.c | -rw-r--r-- | 46.6 KB |
| bwamem.h | -rw-r--r-- | 7.8 KB |
| bwamem_extra.c | -rw-r--r-- | 4.3 KB |
| bwamem_pair.c | -rw-r--r-- | 17.0 KB |
| bwt.c | -rw-r--r-- | 15.0 KB |
| bwt.h | -rw-r--r-- | 4.8 KB |
| bwtindex.c | -rw-r--r-- | 9.0 KB |
| example.c | -rw-r--r-- | 1.8 KB |
| fastmap.c | -rw-r--r-- | 18.2 KB |
| is.c | -rw-r--r-- | 6.5 KB |
| kbtree.h | -rw-r--r-- | 15.5 KB |
| khash.h | -rw-r--r-- | 20.4 KB |
| kseq.h | -rw-r--r-- | 8.6 KB |
| ksort.h | -rw-r--r-- | 9.5 KB |
| kstring.c | -rw-r--r-- | 703 bytes |
| kstring.h | -rw-r--r-- | 2.3 KB |
| ksw.c | -rw-r--r-- | 25.5 KB |
| ksw.h | -rw-r--r-- | 5.0 KB |
| kthread.c | -rw-r--r-- | 3.7 KB |
| kvec.h | -rw-r--r-- | 2.9 KB |
| main.c | -rw-r--r-- | 2.9 KB |
| malloc_wrap.c | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
| malloc_wrap.h | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
| qualfa2fq.pl | -rwxr-xr-x | 617 bytes |
| rle.c | -rw-r--r-- | 4.7 KB |
| rle.h | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
| rope.c | -rw-r--r-- | 8.8 KB |
| rope.h | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
| utils.c | -rw-r--r-- | 6.8 KB |
| utils.h | -rw-r--r-- | 3.7 KB |
| xa2multi.pl | -rwxr-xr-x | 731 bytes |
