https://github.com/lh3/bwa
Tip revision: 3efb7c0e91e5232f4858d9e6033bd5eb9de2348b authored by Heng Li on 31 March 2014, 19:27:23 UTC
r455: release bwa-0.7.8
r455: release bwa-0.7.8
Tip revision: 3efb7c0
| File | Mode | Size |
|---|---|---|
| .gitignore | -rw-r--r-- | 55 bytes |
| COPYING | -rw-r--r-- | 34.3 KB |
| ChangeLog | -rw-r--r-- | 122.7 KB |
| Makefile | -rw-r--r-- | 2.8 KB |
| NEWS | -rw-r--r-- | 30.9 KB |
| QSufSort.c | -rw-r--r-- | 12.3 KB |
| QSufSort.h | -rw-r--r-- | 1.6 KB |
| README.md | -rw-r--r-- | 3.3 KB |
| bamlite.c | -rw-r--r-- | 6.0 KB |
| bamlite.h | -rw-r--r-- | 3.1 KB |
| bntseq.c | -rw-r--r-- | 11.2 KB |
| bntseq.h | -rw-r--r-- | 2.5 KB |
| bwa.1 | -rw-r--r-- | 24.3 KB |
| bwa.c | -rw-r--r-- | 10.9 KB |
| bwa.h | -rw-r--r-- | 1.8 KB |
| bwamem.c | -rw-r--r-- | 40.9 KB |
| bwamem.h | -rw-r--r-- | 6.9 KB |
| bwamem_pair.c | -rw-r--r-- | 14.8 KB |
| bwape.c | -rw-r--r-- | 28.6 KB |
| bwase.c | -rw-r--r-- | 19.0 KB |
| bwase.h | -rw-r--r-- | 1.0 KB |
| bwaseqio.c | -rw-r--r-- | 6.7 KB |
| bwt.c | -rw-r--r-- | 13.9 KB |
| bwt.h | -rw-r--r-- | 4.5 KB |
| bwt_gen.c | -rw-r--r-- | 52.6 KB |
| bwt_lite.c | -rw-r--r-- | 2.6 KB |
| bwt_lite.h | -rw-r--r-- | 653 bytes |
| bwtaln.c | -rw-r--r-- | 10.8 KB |
| bwtaln.h | -rw-r--r-- | 3.7 KB |
| bwtgap.c | -rw-r--r-- | 8.9 KB |
| bwtgap.h | -rw-r--r-- | 999 bytes |
| bwtindex.c | -rw-r--r-- | 8.4 KB |
| bwtsw2.h | -rw-r--r-- | 1.5 KB |
| bwtsw2_aux.c | -rw-r--r-- | 24.4 KB |
| bwtsw2_chain.c | -rw-r--r-- | 3.0 KB |
| bwtsw2_core.c | -rw-r--r-- | 18.5 KB |
| bwtsw2_main.c | -rw-r--r-- | 3.7 KB |
| bwtsw2_pair.c | -rw-r--r-- | 10.1 KB |
| example.c | -rw-r--r-- | 1.9 KB |
| fastmap.c | -rw-r--r-- | 11.5 KB |
| is.c | -rw-r--r-- | 6.5 KB |
| kbtree.h | -rw-r--r-- | 15.5 KB |
| khash.h | -rw-r--r-- | 20.4 KB |
| kopen.c | -rw-r--r-- | 9.5 KB |
| kseq.h | -rw-r--r-- | 8.7 KB |
| ksort.h | -rw-r--r-- | 9.5 KB |
| kstring.c | -rw-r--r-- | 703 bytes |
| kstring.h | -rw-r--r-- | 2.3 KB |
| ksw.c | -rw-r--r-- | 24.8 KB |
| ksw.h | -rw-r--r-- | 5.0 KB |
| kthread.c | -rw-r--r-- | 1.3 KB |
| kvec.h | -rw-r--r-- | 2.9 KB |
| main.c | -rw-r--r-- | 4.2 KB |
| malloc_wrap.c | -rw-r--r-- | 1.4 KB |
| malloc_wrap.h | -rw-r--r-- | 1.2 KB |
| pemerge.c | -rw-r--r-- | 8.6 KB |
| qualfa2fq.pl | -rwxr-xr-x | 616 bytes |
| utils.c | -rw-r--r-- | 6.6 KB |
| utils.h | -rw-r--r-- | 3.7 KB |
| xa2multi.pl | -rwxr-xr-x | 730 bytes |
